人恶性腹水的定量蛋白质组学分析

主题标签:肿瘤、腹膜癌病、蛋白质组学、恶性腹水、定量分析。本站分类:肿瘤/腹膜癌病。本数据集为肿瘤领域公开数据集,主题涵盖肿瘤。

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蛋白质回归肿瘤腹膜癌病蛋白质组学恶性腹水定量分析
Quantitative proteomic analysis of human malignant ascites

基本信息

模态
蛋白质
任务类型
回归
创建/更新时间
2026-10-09

资源简介

人恶性腹水的定量蛋白质组学分析

本数据集为一项公开的肿瘤领域蛋白质组学研究数据,英文名称为 Quantitative proteomic analysis of human malignant ascites,即人恶性腹水的定量蛋白质组学分析。该数据集在分类上归属于肿瘤 / 腹膜癌病方向,来源站为 ebi.ac.uk,其源站描述记录为 Dohyun Han (2018). Quantitative proteomic analysis of human malignant ascites [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD004501。从主题标签来看,该数据集围绕肿瘤、腹膜癌病、蛋白质组学、恶性腹水以及定量分析等关键词展开,属于肿瘤领域公开数据集,主题涵盖肿瘤。整体而言,该数据集面向恶性腹水这一与腹膜癌病密切相关的临床样本类型,通过定量蛋白质组学手段进行系统分析,为相关研究提供数据支撑。

【数据集背景】

恶性腹水是腹膜癌病等肿瘤进展过程中常见的临床表现,其成分复杂,包含多种蛋白质,能够反映肿瘤微环境及机体病理状态。围绕恶性腹水开展定量蛋白质组学分析,有助于从蛋白质层面理解腹膜癌病相关的分子特征。本数据集即以此为背景,聚焦人恶性腹水的定量蛋白质组学分析,归属于肿瘤 / 腹膜癌病分类,属于肿瘤领域公开数据集,主题涵盖肿瘤。源站未提供该数据集更具体的立项背景、研究假设或项目目标。

【数据内容】

该数据集的核心内容为人恶性腹水的定量蛋白质组学分析数据。根据主题标签,其内容涉及肿瘤、腹膜癌病、蛋白质组学、恶性腹水以及定量分析。数据集英文名称明确指向“human malignant ascites”的“Quantitative proteomic analysis”,表明数据围绕人恶性腹水样本的蛋白质定量展开。源站未提供样本数量、蛋白质鉴定数量、定量方法细节、实验分组、数据文件类型及具体数据表结构等信息。

【采集与来源】

该数据集来源站为 ebi.ac.uk,源站描述记录为 Dohyun Han (2018). Quantitative proteomic analysis of human malignant ascites [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD004501。由此可知,数据集由 Dohyun Han 于 2018 年发布,并通过 ebi.ac.uk 平台公开。源站未提供样本采集地点、采集时间、伦理审批信息、样本处理流程及仪器平台等具体采集细节。

【适用场景】

该数据集适用于肿瘤及腹膜癌病相关研究领域,尤其是围绕恶性腹水开展蛋白质组学分析的场景。其主题涵盖肿瘤,并涉及蛋白质组学与定量分析,可用于支持对恶性腹水中蛋白质表达特征的研究探索。由于归属于肿瘤 / 腹膜癌病分类,该数据集也可作为该方向公开数据资源,供相关研究人员参考使用。源站未提供该数据集具体的适用分析任务、推荐工具或预期应用结论。

【使用方法】

该数据集为公开数据集,来源站为 ebi.ac.uk,源站描述中给出了访问链接 https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD004501。使用者可通过该链接访问数据集页面,了解并获取相关数据。源站未提供具体的数据下载格式、预处理步骤、分析流程或软件使用说明。

【质量与限制】

该数据集为肿瘤领域公开数据集,主题涵盖肿瘤,来源站为 ebi.ac.uk,发布者为 Dohyun Han,发布年份为 2018 年。源站未提供数据质量评估指标、缺失值情况、批次效应说明、样本代表性分析及使用限制等具体信息。

【引用与许可】

该数据集的引用信息为:Dohyun Han (2018). Quantitative proteomic analysis of human malignant ascites [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD004501。源站未提供该数据集的具体许可条款、使用授权范围及再分发要求等信息。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD004501

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Dohyun Han (2018). Quantitative proteomic analysis of human malignant ascites [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD004501

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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