儿童脑肿瘤溶瘤病毒敏感性基因预测数据集
基于14种儿童脑肿瘤细胞系的RNA-seq数据，预测4种溶瘤病毒敏感性，揭示基因分子谱对疗效的预测作用。
基本信息
资源简介
儿童脑肿瘤溶瘤病毒敏感性基因预测数据集
【一句话概览】
本数据集是 NCBI 公开的组学数据集，收录 1 个文件，主题涵盖 GPL24676、9606，可用于生物标志物发现与分子分型研究。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《The heterogeneous sensitivity of pediatric brain tumors to different oncolytic viruses is predicted by unique gene molecular profiles》。源站首次发布：Feb 28 202。
【数据内容】
源站原始描述：Despite decades of research, the prognosis of high-grade pediatric brain tumors (PBTs) remains dismal, however, recent cases of favorable clinical responses were documented in clinical trials using oncolytic viruses (OVs). Therefore, we employ four different species of OVs: adenovirus Delta24-RGD, herpes simplex virus rQNestin34.5v1, reovirus R124 and the non-virulent Newcastle Disease Virus rNDV-F0-GFP against three entities of PBTs (high-grade gliomas, atypical teratoid/rhabdoid tumors and epe…
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个。
【主题与分类】
主题标签：GPL24676、9606。
【适用方向】
组学数据适用于生物标志物发现与分子分型相关建模研究。
【获取与许可】
源站页面：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE260516
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jul 29 202，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE260516
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- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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