IDC HTAN-WUSTL 胰腺导管腺癌数据集

数据以 DICOM 转换的 Slide Microscopy 图像形式提供,可用于胰腺导管腺癌的病理图像分析,如分类、分割等任务,并可通过关联的 Zenodo 信息页获取更多图像说明与支持性元数据(来源 portal.imaging.datacommons.cancer.gov)

idc
浏览 7
医学影像分类Ductal adenocarcinomaPancreas
IDC HTAN-WUSTL

基本信息

模态
医学影像
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-06

资源简介

IDC HTAN-WUSTL 胰腺导管腺癌数据集

IDC HTAN-WUSTL 是一个聚焦胰腺癌的医学影像数据集,收录于本站肿瘤 / 胰腺癌分类之下,来源为 portal.imaging.datacommons.cancer.gov。该数据集围绕胰腺导管腺癌(Ductal adenocarcinoma)这一癌种构建,肿瘤位置为胰腺(Pancreas),共包含 21 名受试者的数据。数据以 DICOM 转换的 Slide Microscopy 图像形式提供,可用于胰腺导管腺癌的病理图像分析,例如分类、分割等任务。源站同时提示,可通过关联的 Zenodo 信息页获取更多关于图像的说明以及该集合的支持性元数据。

【数据集背景】

该数据集属于 IDC 集合中的 HTAN-WUSTL 部分。其癌种为胰腺导管腺癌,肿瘤位置为胰腺,受试者数量为 21。数据集的主题标签为 Ductal adenocarcinoma 与 Pancreas。源站描述指出,如需进一步了解图像情况并获取该集合的支持性元数据,可参阅 HTAN-WUSTL 集合的 DICOM 转换 Slide Microscopy 图像信息页,该信息页对应 DOI 为 https://doi.org/10.5281/zenodo.12689993。

【数据内容】

数据以 DICOM 转换的 Slide Microscopy 图像形式提供。源站描述中明确提及“DICOM converted Slide Microscopy images”,即这些图像是经过 DICOM 转换的幻灯片显微图像。数据集覆盖的癌种为胰腺导管腺癌,肿瘤位置为胰腺,受试者为 21 例。除上述信息外,关于图像的具体数量、分辨率、染色方式、扫描设备参数等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 portal.imaging.datacommons.cancer.gov。源站将其标识为 IDC collection HTAN-WUSTL。数据以 DICOM 转换的 Slide Microscopy 图像形式提供,并关联到一个 Zenodo 信息页(https://doi.org/10.5281/zenodo.12689993),该页面用于了解图像详情并获取支持性元数据。关于原始采集机构、采集时间、扫描协议、伦理审批信息等,源站未提供。

【适用场景】

根据源站描述与主题标签,该数据集可用于胰腺导管腺癌的病理图像分析,例如分类、分割等任务。由于数据以 Slide Microscopy 图像形式提供,其典型用途涉及对胰腺组织切片图像的识别与处理。关于具体可支持的模型类型、评价指标或基准任务,源站未提供。

【使用方法】

源站描述提示,可通过 HTAN-WUSTL 集合的 DICOM 转换 Slide Microscopy 图像信息页(https://doi.org/10.5281/zenodo.12689993)了解图像详情并获取该集合的支持性元数据。关于数据下载方式、目录结构、读取工具、预处理步骤等,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集包含 21 名受试者,癌种为胰腺导管腺癌,肿瘤位置为胰腺。关于图像质量、标注完整性、类别平衡、潜在偏倚、样本量限制等,源站未提供。

【引用与许可】

源站描述中给出了关联的 Zenodo 信息页 DOI:https://doi.org/10.5281/zenodo.12689993,用于了解图像详情并获取支持性元数据。关于该数据集的正式引用格式、许可条款、使用限制等,源站未提供。

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://portal.imaging.datacommons.cancer.gov/explore/filters?collection_id=htan_wustl

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

IDC收集 HTAN-WUSTL。癌症类型:导管腺癌。肿瘤位置:胰腺。受试者:21。请参阅HTAN-WUSTL收集的DICOM转换的幻灯片显微镜图像(https://doi.org/10.5281/zenodo.12689993)信息页面,以了解更多关于这些图像的信息,并获取该收集的任何支持性元数据。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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