卵巢癌中POTE基因的表观遗传激活
该数据集包含卵巢癌（特别是高级别浆液性癌）和正常输卵管上皮的RNA测序与DNA甲基化组数据，主要研究POTE基因家族在卵巢癌中的表达调控机制，涉及表观遗传修饰如DNA低甲基化、LINE-1序列变化及着丝粒周围激活，旨在探索POTE基因过表达与化疗耐药、患者生存率的关系，并为表观遗传靶向治疗提供数据支持。
基本信息
资源简介
卵巢癌中POTE基因的表观遗传激活
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Epigenetic activation of POTE genes in ovarian cancer》。配套论文《Epigenetic activation of <i>POTE</i> genes in ovarian cancer》发表于 Epigenetics（2019），DOI：10.1080/15592294.2019.1581590。项目资助方：This project was supported by NIH RO1CA116674, The Betty J. and Charles D. McKinsey Ovarian Cancer Research Fund, the FPBCC Support Grant (NIH P30CA036727), and the RPCCC Support Grant (NIH P30CA016056).。源站首次发布：2019-02-15。
【数据内容】
源站原始描述：The POTE gene family consists of 14 homologous genes localized to autosomal pericentromeres, and a sub-set of POTEs are cancer-testis antigen (CTA) genes. POTEs are over-expressed in epithelial ovarian cancer (EOC), including the high-grade serous subtype (HGSC), and expression of individual POTEs correlates with chemoresistance and reduced survival in HGSC. The mechanisms driving POTE overexpression in EOC and other cancers is unknown. Here, we investigated the role of epigenetics in regulating…
【数据结构与技术规格】
文件数 8 个，合计 736.60 KB。Fig S1 Affy Figure.pptx：application/vnd.openxmlformats-officedocument.presentationml.presentation，49.24 KB。Fig S2 Expression v Methylation Heat Maps.pptx：application/vnd.openxmlformats-officedocument.presentationml.presentation，242.13 KB。Fig S3 POTE methylation w DAC & in DKO.pptx：application/vnd.openxmlformats-officedocument.presentationml.presentation，69.62 KB。数据集 DOI：10.6084/m9.figshare.7724987.v1。
【主题与分类】
源站学科分类：Cell Biology、Genetics、Molecular Biology、Evolutionary Biology、Ecology、Immunology。主题标签：POTE、Ovarian cancer、high-grade serous ovarian cancer、DNA hypomethylation、pericentromeres、LINE1。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Cell Biology、Genetics、Molecular Biology、Evolutionary Biology、Ecology、Immunology。
【获取与许可】
源站页面：https://tandf.figshare.com/articles/dataset/Epigenetic_activation_of_i_POTE_i_genes_in_ovarian_cancer/7724987
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Epigenetic activation of POTE genes in ovarian cancer. Taylor & Francis. Sharma, Ashok; Albahrani, Mustafa; Zhang, Wa; Kufel, Christina N.; James, Smitha R.; Odunsi, Kunle; et al
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-06-01，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
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按页面 Download 按钮获取。
数据说明
该数据集聚焦于卵巢癌中POTE基因家族的表观遗传调控机制研究。数据包含来自卵巢癌（特别是高级别浆液性癌HGSC）和正常输卵管上皮（FTE）的RNA测序和DNA甲基化组数据，分析了POTE基因（如POTE C, E, F）的表达变化及其与DNA低甲基化（包括全局、POTE特异性LINE-1序列及5’'启动子/增强子区域）的关联。数据来源为患者样本和细胞系实验，通过地西他滨处理、DNMT敲除细胞系以及组蛋白去乙酰化酶（HDAC）和组蛋白甲基转移酶（HMT）靶向药物组合验证了DNA甲基化对POTE表达的抑制作用。主要研究方向包括探索POTE作为癌症-睾丸抗原（CTA）在卵巢癌中的过表达机制、表观遗传改变（如着丝粒周围激活、低甲基化）与化疗耐药及生存率的关系，以及潜在的表观遗传治疗靶点。
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