GSE73517 神经母细胞瘤高通量测序基因组评估数据集
包含105例具有高危和低危特征的儿童神经母细胞瘤肿瘤样本,旨在利用RNA-seq平台构建基于基因表达的神经母细胞瘤分类器。由University of Cologne提供,来自Gene Expression Omnibus,数据格式为表格。

基本信息
资源简介
GSE73517 神经母细胞瘤高通量测序基因组评估数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《RNA expression data from primary neuroblastoma tumors》。源站首次发布:Sep 28 201。
【数据内容】
源站原始描述:RNA expression profiles of 105 primary neuroblastomas derived from customized 4 x 44k oligonucleotide microarrays (Agilent Technologies). These profiles are part of an integrative study combining genomewide epigenetic profiles with transcriptome data of the same neuroblastoma cohort. Tumors were derived from 40 low-risk, 9 intermediate-risk and 56 high-risk patients
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个。
【主题与分类】
主题标签:Expression profiling by array、GPL16876、9606。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE73517
【使用注意】
· 源站最后修改于 Sep 19 201,引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE73517
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 1.20 GB。
数据说明
包含105例具有高危和低危特征的儿童神经母细胞瘤肿瘤样本,旨在利用RNA-seq平台构建基于基因表达的神经母细胞瘤分类器。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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