GSE3960 神经母细胞瘤cDNA微阵列数据集
包含101例原发性神经母细胞瘤患者肿瘤标本的经典cDNA微阵列基因谱，是早期机器学习在神经母细胞瘤预后评估中高频引用的基准数据集。由Philipps University Marburg提供，来自Gene Expression Omnibus，数据格式为表格，适用于分类任务。
基本信息
资源简介
GSE3960 神经母细胞瘤cDNA微阵列数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Classification of neuroblastoma by integrating gene expression pattern with regional alterations in DNA copy number》。源站首次发布：Jan 03 200。
【数据内容】
源站原始描述：The specific genes that influence neuroblastoma biology and are targeted by genomic alterations remain largely unknown. We quantified mRNA expression in a highly annotated series of 101 prospectively collected diagnostic neuroblastoma primary tumors and the expression profiles were determined using Affymetrix U95Av2 arrays. Comparisons between the sample groups allow the identification of genes with localized expression patterns. This study demonstrates that the genomic data can be used to subca…
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个。
【主题与分类】
主题标签：Expression profiling by array、GPL8300、9606。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE3960
【使用注意】
· 源站最后修改于 Dec 13 201，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE3960
标准获取流程：
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- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 0.08 GB。
数据说明
包含101例原发性神经母细胞瘤患者肿瘤标本的经典cDNA微阵列基因谱，是早期机器学习在神经母细胞瘤预后评估中高频引用的基准数据集。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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