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人与小鼠视网膜空间蛋白质组图谱
主题标签:空间蛋白质组、视网膜、人类、小鼠、肿瘤、胰腺癌。本数据集为肿瘤领域公开数据集,主题涵盖空间蛋白质组。本数据集为肿瘤领域的蛋白质公开数据集,来源:google_dataset,主题涵盖空间蛋白质组。

CellFuse:单细胞与空间蛋白质组学数据多模态整合用于癌症系统级分析
该数据集来自 zenodo.org,是 CellFuse 论文的可复现仓库,包含代码与数据,用于重现论文图表。内容聚焦骨髓样本的单细胞与空间蛋白质组学数据多模态整合,提供数据准备、CellFuse 运行、Harmony、Seurat、FastMNN、scanorama、scVI 等基准方法运行、sc

SpatialSort 支持数据集
该数据集为论文 SpatialSort: A Bayesian Model for Clustering and Cell Population Annotation of Spatial Proteomics Data 的配套支持数据,包含前向模拟数据集、空间高斯混合数据集、半真实数据集和 MIB

APOBEC3A 是台湾 APOBEC 缺失多态性携带者的口腔癌预后生物标志物
研究整合 50 对匹配样本的多组学分析,发现与胞苷脱氨酶 APOBEC 相关的突变特征,并与 22q13 的 APOBEC3 基因簇中 APOBEC3A 表达上调相关;携带 APOBEC3B 缺失等位基因的肿瘤中 APOBEC3A 表达更高,高水平表达与更好总生存相关,并在第二队列(n=188)中验

HOX基因:促进喉鳞状细胞癌发展的潜在候选基因
该数据集来自omicsdi.org,聚焦喉鳞状细胞癌(LSCC)的转录组学研究。通过分析肿瘤样本发现,同源盒基因家族(HOX)的8个成员在LSCC样本中的表达量是正常喉组织的200倍,并经qPCR验证

头颈部鳞状细胞癌中与饮酒和吸烟相关的体细胞拷贝数变异
该数据集来自 omicsdi.org,聚焦头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)中与饮酒、吸烟及病毒感染相关的全基因组体细胞拷贝数变异,同时涉及 p16 蛋白表达和 TP53 突变

HPV阴性头颈癌患者配对RNA-Seq与miRNA-Seq样本数据
该数据集来自omicsdi.org,包含34例人乳头瘤病毒(HPV)阴性头颈癌患者的109份配对样本的RNA-Seq与miRNA-Seq fastq文件,样本类型包括72份淋巴结、29份肿瘤和8份正常组织

亚洲头颈癌细胞系CRISPR/Cas9致死性筛选样本数据
该数据集来自omicsdi.org,收录了在亚洲头颈癌细胞系中开展CRISPR/Cas9致死性筛选以识别新靶点的研究数据,包含截至2020年1月15日该研究可获取的全部数据

头颈鳞癌与鼻咽癌TCR-beta序列样本数据集
该数据集来源于omicsdi.org,收录了10例头颈部鳞状细胞癌和19例鼻咽癌样本的TCR-beta序列。文库构建采用针对VDJ区域定制的靶向扩增方法,测序平台为Illumina MiSeq

烟草烟雾诱导头颈癌突变结构变异VCF文件(Mutographs)
该数据集来源于omicsdi.org,主题标签为Genomics,属于肿瘤/其他分类。数据内容为烟草烟雾诱导头颈癌突变复杂性的结构变异VCF文件,来自Mutographs项目

亚洲头颈癌细胞系外显子组测序样本数据集
该数据集来自 omicsdi.org,包含一组亚洲头颈癌细胞系的外显子组测序数据,旨在识别可用于对细胞系进行基因组分类的突变

OncoArray:口腔与咽癌
该数据集来自 omicsdi.org,聚焦口腔与口咽癌易感性的遗传变异研究,基于 OncoArray Network 专为癌症研究设计的基因分型工具开展大规模 GWAS
