TTUHSC PDX COG-N-623x 肾上腺神经母细胞瘤

主题标签:神经母细胞瘤、肾上腺肿瘤、PDX模型、TTUHSC、NSG小鼠、皮下移植。本数据集为肿瘤领域公开数据集,主题涵盖神经母细胞瘤。

biostudies
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基因组分类神经母细胞瘤肾上腺肿瘤PDX模型TTUHSCNSG小鼠皮下移植
[TTUHSC] [PDX] [COG-N-623x] Adrenal Gland Neuroblastoma

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

TTUHSC PDX COG-N-623x 肾上腺神经母细胞瘤

本数据集英文名称为 [TTUHSC] [PDX] [COG-N-623x] Adrenal Gland Neuroblastoma,属于肿瘤领域的公开数据集,来源站为 ebi.ac.uk,本站分类归入肿瘤 / 其他。数据集主题涵盖神经母细胞瘤,并涉及肾上腺肿瘤、PDX 模型、TTUHSC、NSG 小鼠、皮下移植等主题标签。该数据集围绕一位男性供体来源的肾上腺腺瘤(NOS)肿瘤样本构建,样本于 2016 年 3 月接受第二次手术获取,并移植至 NOD.Cg-Prkdc scid Il2rg tm1Wjl /SzJ 小鼠品系,采用皮下组织片段新鲜移植方式。整体而言,该数据集为神经母细胞瘤及肾上腺肿瘤研究提供了 PDX 模型相关的公开数据资源。

【数据集背景】

该数据集来源于 Texas Tech University Health Sciences Center(TTUHSC),属于肿瘤研究领域中的 PDX(患者来源异种移植)模型数据。其英文名称中包含 COG-N-623x 标识,提示该模型可能与特定研究编号或样本编号相关。数据集聚焦于肾上腺腺瘤(NOS)这一肿瘤类型,并以神经母细胞瘤作为主题标签之一。从来源站信息看,该数据集通过 ebi.ac.uk 公开,本站将其归入肿瘤 / 其他分类。整体背景涉及神经母细胞瘤、肾上腺肿瘤、PDX 模型、TTUHSC、NSG 小鼠及皮下移植等关键词,反映其属于肿瘤学基础与转化研究中的模型资源。

【数据内容】

数据集内容围绕一位男性供体的肾上腺腺瘤(NOS)肿瘤样本展开。该样本被描述为原发性神经系统癌症相关,但具体信息未提供。样本于 2016 年 3 月通过第二次手术获取,随后以皮下组织片段新鲜移植的方式植入 NSG 小鼠(NOD.Cg-Prkdc scid Il2rg tm1Wjl /SzJ)体内。数据集中涉及的关键要素包括:肿瘤类型为肾上腺腺瘤(NOS),移植方式为皮下移植,移植材料为新鲜组织片段,宿主为 NSG 小鼠。此外,数据集还包含与神经母细胞瘤相关的主题标签。关于样本的分子特征、基因表达、突变信息、药物响应数据等具体内容,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的采集与来源信息显示,样本来自 Texas Tech University Health Sciences Center(TTUHSC)。供体为男性,肿瘤类型为肾上腺腺瘤(NOS),样本获取时间为 2016 年 3 月,且为第二次手术。移植宿主为 NOD.Cg-Prkdc scid Il2rg tm1Wjl /SzJ 小鼠品系,移植部位为皮下,移植材料为新鲜组织片段。来源站为 ebi.ac.uk,源站描述中提及 Creative Commons Zero v1.0 Universal(CC0 1.0)公共领域贡献许可。关于样本的伦理审批、患者知情同意、具体手术医院或科室等信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于肿瘤学中 PDX 模型相关的研究场景,尤其是涉及神经母细胞瘤和肾上腺肿瘤的临床前研究。具体而言,可用于研究肾上腺腺瘤(NOS)在 NSG 小鼠体内的皮下移植模型建立与生长特性,也可用于探索神经母细胞瘤相关主题下的肿瘤生物学行为。此外,该数据集可作为 PDX 模型资源,用于药物筛选、肿瘤异质性研究或转化医学研究中的模型对照。由于数据集包含明确的供体性别、肿瘤类型、移植方式和宿主品系信息,适合用于模型复现或方法学参考。关于具体适用疾病亚型、治疗靶点或生物标志物研究,源站未提供。

【使用方法】

使用该数据集时,可依据其提供的 PDX 模型信息进行实验设计或数据分析。具体使用方法包括:参考其皮下移植新鲜组织片段的技术路线,在 NSG 小鼠中建立类似模型;利用其肿瘤类型和供体信息进行分组或对照设置;结合神经母细胞瘤主题标签,开展相关肿瘤生物学研究。数据集来源为 ebi.ac.uk,用户可通过该来源站获取公开数据。关于数据的具体下载格式、文件结构、访问权限或配套分析工具,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集的质量与限制信息中,源站未提供关于样本质量评估、数据完整性、测序深度、模型验证或重复性等方面的具体说明。已知限制包括:样本信息中部分字段标注为“Not Provided”或“Not provided”,例如具体癌症类型描述、部分临床信息等。此外,数据集仅涉及单一供体来源的肾上腺腺瘤(NOS)样本,可能限制其普适性。关于模型是否经过组织学验证、是否具有可重复的传代能力、是否存在小鼠适应相关遗传改变等,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集的许可信息显示为 Creative Commons Zero v1.0 Universal(CC0 1.0)公共领域贡献许可,允许在无附加限制的情况下使用、修改和分发。来源站为 ebi.ac.uk。关于具体的引用格式、推荐引用文献、数据提交者或机构联系方式,源站未提供。用户在使用时应遵循 CC0 1.0 许可条款,并建议注明数据来源站及数据集英文名称。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/S-CMO8433

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

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