TCGA泛癌染色体8q24.3基因组定位吸引子

描述里附有一个指向 Dropbox 的链接,对应页面为。除此之外,关于项目设计、样本选择、分析流程、研究目的等背景信息,源站未提供

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基因组基因组学拷贝数变异染色体位点肿瘤学癌症研究数据可视化生物信息学
TCGA Pan Cancer chr8q24.3 Genomically Localized Attractor

基本信息

模态
基因组
创建/更新时间
2026-10-01

资源简介

TCGA泛癌染色体8q24.3基因组定位吸引子

TCGA Pan Cancer chr8q24.3 Genomically Localized Attractor 是一个归类为肿瘤 / 其他的数据集,发布在 synapse.org,内容围绕 TCGA Pan Cancer Project 中 chr8q24.3 区域的 genomically localized attractor,源站提供的入口可查看相关 HTML 表格。

【数据集背景】

该数据集的背景与 TCGA Pan Cancer Project 有关。源站描述指出,它给出的是在 TCGA Pan Cancer Project(syn362400)中发现的 chr8q24.3 genomically localized attractor 的详情。描述里附有一个指向 Dropbox 的链接,对应页面为 http://dl.dropbox.com/u/11986954/panCancer/tcgaPanCancer.chr8q24_3.html。除此之外,关于项目设计、样本选择、分析流程、研究目的等背景信息,源站未提供。

【数据内容】

源站说明该页面包含 chr8q24.3 genomically localized attractor 的详细信息,并提示点击 “Download” 可以看到 HTML 表格。因此,其可获取内容以 HTML 表格形式呈现,主题集中在 TCGA Pan Cancer Project 中 chr8q24.3 的 genomically localized attractor。表格具体包含哪些字段、多少行、多少列、是否附带注释、是否包含图形或补充文件,源站未提供。数据集分类标记为肿瘤 / 其他,表明其在站内归入肿瘤相关类别下的其他类型。更多数据字典、变量定义、文件格式清单、版本说明等,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源站为 synapse.org。源站描述给出的访问入口是一个 Dropbox 链接,页面名称为 tcgaPanCancer.chr8q24_3.html;描述中还标注了 syn362400。可见其与 TCGA Pan Cancer Project 相关,并由上述来源页面提供详情。至于原始数据如何采集、样本来自何处、经过哪些处理步骤、由谁生成、何时生成、更新频率如何,源站未提供。

【适用场景】

源站未提供明确的适用场景说明。根据已有描述,该数据集面向关注 TCGA Pan Cancer Project 中 chr8q24.3 genomically localized attractor 的使用者,可用于查阅源站所展示的相关 HTML 表格。是否适合做统计建模、生存分析、突变频谱分析、跨癌种比较、可视化复现或其他研究用途,源站未提供。若使用者需要判断其适用性,应以源站页面和其中表格的实际内容为准。

【使用方法】

使用者可以访问源站描述中的链接,打开 tcgaPanCancer.chr8q24_3.html 页面;源站提示点击 “Download” 以查看 HTML 表格。该页面是查看和获取相关表格信息的主要入口。是否有其他下载格式、API 接口、批量获取方式、配套文档或脚本,源站未提供。由于页面为 HTML 表格形式,使用者需要具备浏览器或能够解析 HTML 表格的工具,才能进一步查看其中内容。上述为源站说明能支持的使用方式,具体操作细节以源站页面为准。

【质量与限制】

源站未提供关于数据质量、完整性、准确性、一致性、缺失情况、批次效应、版本变更、更新日期、样本量、适用范围限制或已知问题的说明。因此,无法从现有信息判断该数据集是否经过同行评审、是否可直接用于临床或转化研究、是否存在访问权限限制。使用者应注意,源站仅给出查看 HTML 表格的提示,未说明表格内容的质量控制过程或验证情况。任何质量评估、偏倚讨论和局限分析,均需以源站未提供的补充材料为准。

【引用与许可】

源站未提供引用格式、作者列表、出版信息、DOI、许可条款、使用限制或商业使用规定。描述中出现了 TCGA Pan Cancer Project(syn362400),可作为相关项目标识;但该标识不等于引用规范或授权许可。若需要引用或再利用该数据集,应回到 synapse.org 上的来源页面,查找源站是否提供正式引用和许可说明。由于当前信息未覆盖这些内容,无法给出具体引用条目或授权结论。

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下载信息

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公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://synapse.org/Synapse:syn1446672

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

http://dl.dropbox.com/u/11986954/panCancer/tcgaPanCancer.chr8q24_3.html 有关在 TCGA 泛癌项目(syn362400)中发现的 chr8q24.3 基因组定位吸引子的详细信息。点击“Download”查看 html 表格。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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