单细胞RNA测序揭示肌层浸润性膀胱癌中成纤维细胞与T细胞相互作用

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源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3A0a330ef008917182e8d451a6cf582aaf42f9f91bd66954dab7db5ad7f97c45d1

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数据说明

肌层浸润性膀胱癌（MIBC）以复杂的肿瘤微环境（TME）为特征，该微环境驱动肿瘤侵袭性进展和治疗耐药。既往研究已强调癌症相关成纤维细胞（CAFs）和耗竭T（Tex）细胞在MIBC中的作用，但其相互作用机制仍知之甚少。本研究对来自12例患者的19份组织样本——包括7份MIBC、3份非肌层浸润性膀胱癌（NMIBC）和9份正常组织样本——进行单细胞RNA测序，鉴定出13个转录上不同的成纤维细胞簇和10个功能异质性的T细胞亚群。两种干扰素（IFN）应答性成纤维细胞群体，即F-ISG15（炎性CAFs）和F-POSTN（肌成纤维细胞样CAFs），被证实在MIBC的TME中占主导地位。体内实验表明，Tex细胞分泌的IFN-γ极化CAFs分泌CXCL12，后者通过CXCL12-CXCR4趋化轴招募表达CXCR4的T细胞。

空间分析揭示了一个双向环路：Tex衍生……，# 用于肌层浸润性膀胱癌研究的单细胞RNA测序数据集 该数据集背后的实验工作概述 该数据集旨在探索肌层浸润性膀胱癌（MIBC）肿瘤微环境（TME）中癌症相关成纤维细胞（CAFs）与耗竭T（Tex）细胞之间复杂的相互作用。组织样本采集自12名患者，包括7例MIBC、3例非肌层浸润性膀胱癌（NMIBC）和9份正常组织样本。对这些样本中分离出的共计127,391个细胞进行了单细胞RNA测序（scRNA-seq）。随后对数据进行了全面分析，以鉴定不同细胞类型、成纤维细胞和T细胞亚型，并揭示调控其相互作用的分子机制。此外，通过免疫组织化学、免疫荧光、ELISA及其他检测方法进行了实验验证，以支持scRNA-seq分析的发现。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。