RNAseq数据：Fc受体预激活通过长短期机制增强巨噬细胞对IgG敏感性

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5061/dryad.hx3ffbgp1

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 218.03 GB。

数据说明

巨噬细胞通过感知“吃我”信号IgG来识别吞噬目标。我们测试了先前与IgG的接触是否会影响小鼠骨髓来源巨噬细胞的吞噬能力。IgG由Fc受体识别。为了在时间上控制Fc受体的激活，我们设计了一种Fc受体，该受体可通过光诱导的Cry2寡聚化而激活，从而触发吞噬作用。利用这一工具，我们证明亚阈值Fc受体激活能使巨噬细胞在未来的接触中对IgG更加敏感。先前经历过亚阈值Fc受体激活的巨噬细胞会吞噬更多与IgG结合的癌细胞。吞噬作用的增强通过两种不同的机制发生——短期和长期启动。长期启动需要新的蛋白质合成和Erk活性。这些长期的转录变化显示免疫反应基因增加，以及巨噬细胞向M2极化方向的重编程。短期启动不需要新的蛋白质合成，并与Fc受体流动性增加相关。

我们的研究证明，IgG能促使巨噬细胞准备好增强吞噬作用，这表明治疗性抗体在初次激活剂量后可能变得更加有效。此数据集与《发育细胞》杂志中题为“先前Fc受体激活通过长期和短期机制使巨噬细胞对IgG敏感性增加”的手稿中包含的RNAseq数据相关。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。