PRJNA809037：生酮饮食与β-羟基丁酸抑制结直肠癌（亚硫酸氢盐测序数据集）

资源简介

PRJNA809037：生酮饮食与β-羟基丁酸抑制结直肠癌（亚硫酸氢盐测序数据集）

PRJNA809037 是一个来自 NCBI 的亚硫酸氢盐测序数据集，全称为“Suppression of colorectal cancer by ketogenic diet and beta-hydroxybutyrate (Bisulfite Sequencing Dataset)”。该数据集围绕生酮饮食与 β-羟基丁酸（BHB）干预下肠上皮细胞的 DNA 甲基化展开，提供相应的亚硫酸氢盐测序原始序列读取。数据以 Raw sequence reads 形式组织，属于肿瘤领域的其他类数据资源，可用于分析干预条件下肠上皮细胞的甲基化变化，进而探索生酮饮食及 BHB 对结直肠癌相关表观遗传调控的影响。

【数据集背景】

该数据集关注生酮饮食与 β-羟基丁酸（BHB）在结直肠癌抑制中的作用，并从表观遗传层面切入，采用亚硫酸氢盐测序对肠上皮细胞进行检测。亚硫酸氢盐测序是研究 DNA 甲基化的常用技术路线，能够将未甲基化的胞嘧啶转化为尿嘧啶，从而在序列层面区分甲基化状态。该数据集将这一技术应用于生酮饮食和 BHB 干预背景下的肠上皮细胞样本，为理解饮食干预与代谢物如何通过 DNA 甲基化影响结直肠癌相关过程提供原始测序数据基础。

【数据内容】

数据集的内容为肠上皮细胞在生酮饮食与 BHB 干预条件下的亚硫酸氢盐测序原始序列读取，主题标签为 Raw sequence reads。数据以原始测序读取的形式提供，未经过汇总或加工为甲基化水平矩阵等衍生结果。其核心信息是样本 DNA 在亚硫酸氢盐处理后的序列读取，可用于后续的甲基化位点识别与甲基化水平分析。

【采集与来源】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov。源站描述指出，其内容为生酮饮食与 BHB 干预下肠上皮细胞的亚硫酸氢盐测序。除上述来源与样本类型信息外，关于样本采集的具体部位、动物或细胞模型、干预时长、测序平台与读长等信息，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于 DNA 甲基化变化分析，尤其是围绕生酮饮食及 BHB 干预对肠上皮细胞表观遗传调控影响的研究。研究者可基于原始序列读取开展甲基化位点鉴定、差异甲基化分析等下游工作，并将其与结直肠癌抑制相关的表观遗传机制探索相结合。由于数据以原始读取形式提供，适合具备亚硫酸氢盐测序数据处理能力的研究者使用。

【使用方法】

使用该数据集时，通常需要先获取原始序列读取，随后进行质量控制、比对与甲基化位点识别等标准亚硫酸氢盐测序分析流程，再开展甲基化水平统计与差异分析。具体的分析流程参数、参考基因组版本及配套元数据，源站未提供，需使用者根据数据实际情况自行确定。

【质量与限制】

该数据集为原始序列读取，未提供加工后的甲基化结果，使用者需自行完成数据处理与质量控制。关于测序深度、样本数量、重复设置、数据质量评估指标等信息，源站未提供。因此，在解释分析结果时需考虑这些信息的缺失，相关结论应结合完整实验设计与元数据加以判断。

【引用与许可】

该数据集来自 NCBI，使用时应遵循 NCBI 的相关数据使用与引用规范。关于该数据集的具体引用文献、作者信息及许可条款，源站未提供。