基本信息

模态

基因组

创建/更新时间

2026-11-04

资源简介

PRJNA1525161：多柔比星联合多糖处理PANC-1胰腺癌细胞的转录组分析

PRJNA1525161 是 NCBI BioProject 数据库收录的一项转录组研究项目，全称为“Transcriptomic profiling of PANC-1 pancreatic cancer cells treated with doxorubicin combined with polysaccharide”。该项目聚焦于 PANC-1 胰腺癌细胞在多柔比星联合多糖处理条件下的转录组变化，数据类型为原始测序读段（Raw sequence reads）。作为 BioProject 体系中的一项记录，它为使用者提供了一个集中入口，用以查找该项目所产生的各类生物学数据及其相关链接。该数据集在分类上归属于肿瘤/其他方向，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，适合对胰腺癌药物治疗机制、联合用药策略以及转录组测序数据感兴趣的科研人员参考使用。

【数据集背景】

BioProject 是 NCBI 建立的一种项目级数据组织方式，用于汇集与某一项研究计划相关的生物学数据。按照源站描述，一个 BioProject 通常源自单一机构或联合体，其记录为用户提供统一入口，以便找到该项目所产生的多种数据类型。PRJNA1525161 正是在这一框架下登记的项目，其研究主题围绕 PANC-1 胰腺癌细胞展开，处理条件为多柔比星与多糖联合使用。胰腺癌是肿瘤研究中的重要对象，而多柔比星是常用的化疗药物之一，多糖则常被研究其与化疗药物联合应用的可能作用。该项目通过转录组分析手段，对这一联合处理条件下的细胞基因表达情况进行测序层面的记录。

【数据内容】

该数据集的主题标签为“Raw sequence reads”，表明其核心数据形式是原始测序读段。这意味着项目所产生的主要数据为高通量测序仪直接输出的序列读取结果，而非经过比对、定量或差异表达分析后的加工数据。从项目名称可知，这些读段来自经多柔比星联合多糖处理的 PANC-1 胰腺癌细胞的转录组测序。转录组测序通常用于捕获细胞在特定条件下转录本的种类与丰度信息，因此该项目的原始读段可用于后续的表达分析。除原始测序读段这一数据类型外，源站未提供关于样本数量、测序平台、读长、数据量等更细颗粒度的信息。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为“ID 1525161 - BioProject - NCBI”。项目编号为 PRJNA1525161，属于 NCBI BioProject 数据库中的一条记录。BioProject 作为项目登记与数据链接的枢纽，本身并不一定直接存储所有原始数据文件，而是提供指向该项目相关数据类型的入口。就本数据集而言，其登记的研究对象为 PANC-1 胰腺癌细胞，实验处理为多柔比星联合多糖，数据产出形式为原始测序读段。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批信息、具体实验操作流程等内容，源站未提供。

【适用场景】

基于其数据类型与研究主题，该数据集可适用于若干分析场景。首先，在肿瘤转录组学研究中，研究者可利用原始测序读段开展质控、比对、转录本组装与表达定量等标准分析流程，以考察多柔比星联合多糖处理对 PANC-1 细胞基因表达谱的影响。其次，在联合用药机制研究中，该数据可作为探索化疗药物与多糖协同作用转录组基础的素材。此外，该数据集也可用于方法学比较、测序数据处理流程的测试，或作为胰腺癌相关公共数据资源的一部分，与其他转录组数据集进行整合分析。需要注意的是，具体适用性取决于使用者对原始读段的处理能力以及研究问题的设定。

【使用方法】

使用该数据集时，通常需要先从 NCBI BioProject 记录 PRJNA1525161 出发，查找其关联的原始测序读段数据。由于主题标签为“Raw sequence reads”，使用者应预期获取的是未经加工的测序读段，而非现成的表达矩阵或差异表达结果。典型流程包括：下载原始读段文件，进行质量评估与过滤，随后依据参考基因组或转录组进行比对或定量，最终开展差异表达、功能富集等下游分析。若需复现该项目的研究结论，还需结合项目所对应的具体实验设计信息。关于数据下载的具体链接、文件格式、样本对应关系及分析建议，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 NCBI BioProject 登记项目，其数据组织遵循 BioProject 的一般框架，但源站描述中并未给出针对该项目的质量评估指标、测序深度、重复次数或数据完整性说明。因此，使用者无法仅凭现有信息判断其数据质量水平。此外，由于数据类型为原始测序读段，数据本身不包含经过验证的生物学结论，任何表达变化或功能推断都需要使用者自行分析并谨慎解释。项目仅涉及 PANC-1 这一细胞系以及多柔比星联合多糖这一特定处理条件，其结果不宜直接外推至其他细胞系、其他药物组合或临床情境。关于样本量、批次效应、对照设置等可能影响结论的因素，源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来自 NCBI BioProject，编号为 PRJNA1525161。使用者在引用时，应指向该 BioProject 记录及其关联的数据资源。关于该数据集的具体引用格式、作者列表、发表文献、数据使用许可或授权条款，源站未提供。因此，在公开发表或二次分发相关数据前，建议使用者直接查阅 NCBI BioProject 页面及相关数据文件所附带的说明，以确认适用的引用规范与使用条件。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJNA1525161

访问原始数据

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付，我们提供全链路闭环服务，让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持？联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

免费样本无法满足模型训练要求？千方提供经三甲医院脱敏、带病理回证与专家标注的商业级专病数据集。

去商城查看获取定制方案

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1525161

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究旨在探讨人PANC-1胰腺癌细胞在多柔比星单独处理与多柔比星联合多糖处理后的转录组变化。采用RNA-seq比较两组之间的基因表达谱。原始测序数据使用Illumina平台生成。该数据集将有助于深入了解多柔比星和多糖在胰腺癌细胞中联合作用的分子机制。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别