PRJNA1435360:靶向IRE1a/XBP1信号轴抑制横纹肌肉瘤生长并促进肌源性分化

该数据集来自NCBI BioProject(ID 1435360),主题为靶向IRE1a/XBP1信号轴抑制横纹肌肉瘤生长并促进肌源性分化,包含原始序列读段(Raw sequence reads)

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时间序列Raw sequence reads
PRJNA1435360: Targeting the IRE1a/XBP1 Signaling Axis Suppresses Rhabdomyosarcoma Growth and Promotes Myogenic Differentiation

基本信息

模态
时间序列
创建/更新时间
2026-11-04

资源简介

PRJNA1435360:靶向IRE1a/XBP1信号轴抑制横纹肌肉瘤生长并促进肌源性分化

PRJNA1435360 是一个来自 NCBI BioProject 的生物学项目数据集,其英文名称为“Targeting the IRE1a/XBP1 Signaling Axis Suppresses Rhabdomyosarcoma Growth and Promotes Myogenic Differentiation”。该数据集围绕靶向 IRE1a/XBP1 信号轴抑制横纹肌肉瘤生长并促进肌源性分化这一主题,收录了相关的原始序列读段(Raw sequence reads)。在分类上,该数据集归属于肿瘤 / 其他类别,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。BioProject 作为生物数据的集合,通常关联单一研究计划,由单一组织或联盟发起,并为用户提供统一入口,以查找该项目所产生的多种数据类型。该数据集的主题标签为“Raw sequence reads”,表明其核心数据形式为原始测序读段。

【数据集背景】

该数据集对应 NCBI BioProject 中编号为 1435360 的项目记录,源站标题为“ID 1435360 - BioProject - NCBI”。从项目名称可以看出,其研究背景聚焦于横纹肌肉瘤这一肿瘤类型,并涉及 IRE1a/XBP1 信号轴。项目名称直接点明了研究主题:靶向 IRE1a/XBP1 信号轴能够抑制横纹肌肉瘤生长,并促进肌源性分化。该数据集即围绕这一研究主题而组织,属于肿瘤 / 其他分类下的生物数据集合。BioProject 记录本身旨在为用户提供一个统一位置,以找到该项目所产生的不同数据类型对应的链接。

【数据内容】

该数据集的主题标签为“Raw sequence reads”,说明其包含的数据类型为原始序列读段。原始序列读段通常指测序仪器直接产出的碱基序列数据,是后续比对、定量和变异分析的基础。结合项目名称,这些原始序列读段应来自与 IRE1a/XBP1 信号轴、横纹肌肉瘤生长抑制以及肌源性分化相关的研究。除“Raw sequence reads”这一主题标签外,关于具体样本数量、测序平台、读长、文件大小或数据量等信息,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,属于 NCBI BioProject 数据库中的一条记录。BioProject 记录由单一组织或联盟发起,用于汇集与单一研究计划相关的生物数据。该项目的英文名称和源站标题均指向 NCBI BioProject ID 1435360。关于样本采集地点、采集时间、采集方法、实验设计细节或具体提交机构等信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于与横纹肌肉瘤、IRE1a/XBP1 信号轴、肌源性分化相关的转录组或序列分析研究。由于包含原始序列读段,其典型用途包括原始数据质控、序列比对、表达定量、差异分析以及后续的功能富集分析等。对于关注靶向 IRE1a/XBP1 信号轴如何影响横纹肌肉瘤生长和分化的研究人员,该数据集可作为原始数据来源。此外,该数据集也可用于方法学验证、数据再分析或与其他相关数据集进行整合分析。关于该数据集是否适用于临床诊断、药物开发或特定实验流程,源站未提供。

【使用方法】

使用者可通过 NCBI BioProject 数据库,以项目 ID 1435360 或项目英文名称进行检索,获取该项目的记录页面。BioProject 记录提供指向该项目所产生的不同数据类型对应链接的统一入口,用户可据此定位原始序列读段数据。原始序列读段通常需要经过质控、过滤、比对或组装等生物信息学处理步骤,才能用于下游分析。具体的数据下载方式、文件格式、分析流程或推荐工具等信息,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来自 NCBI BioProject,属于公共数据库中的项目记录。关于原始序列读段的质量评分、测序深度、覆盖度、批次效应、样本重复数或数据完整性等信息,源站未提供。使用者在使用该数据集时,应自行评估原始序列读段的质量,并结合具体研究目的判断其适用性。此外,该数据集的主题标签为“Raw sequence reads”,可能不包含经过处理的表达矩阵、变异注释或临床信息等衍生数据。关于该数据集的已知限制或注意事项,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov 的 NCBI BioProject 记录,项目 ID 为 1435360。关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款或数据共享政策等信息,源站未提供。使用者在引用或使用该数据集时,应参考 NCBI BioProject 的通用引用规范以及该项目记录页面中可能提供的具体说明。

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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1435360

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Bulk RNA-seq dataset of RD cells expressing either scrambled (SCR), IRE1, or XBP1 shRNA. n=3 each

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