PRJNA1336699：结直肠癌患者微生物组分析
该数据集包含结直肠癌患者配对肿瘤与癌旁非肿瘤结肠组织的16S rRNA基因测序数据，患者以非洲遗传祖先为主。组织样本经新鲜冷冻处理，提取DNA后扩增16S基因V3-V4区域，使用Zymo Quick-16S V3V4 Plus试剂盒建库，并在Illumina MiSeq平台测序
基本信息
资源简介
PRJNA1336699：结直肠癌患者微生物组分析
该数据集包含结直肠癌患者配对肿瘤与癌旁非肿瘤结肠组织的16S rRNA基因测序数据，患者以非洲遗传祖先为主。组织样本经新鲜冷冻处理，提取DNA后扩增16S基因V3-V4区域，使用Zymo Quick-16S V3V4 Plus试剂盒建库，并在Illumina MiSeq平台测序。微生物组成被分析以考察其与肿瘤状态及祖先的关联，遗传祖先通过ADMIXTURE分析（v1.3.0）基于1000 Genomes Project参考群体推断。该研究旨在提高非洲祖先群体在结直肠癌相关微生物组研究中的代表性，可用于微生物组分类与肿瘤状态关联分析（来源 ncbi.nlm.nih.gov）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：该数据集包含从以非洲遗传祖先为主的结直肠癌患者中采集的配对肿瘤与癌旁非肿瘤结肠组织样本的16S rRNA基因测序。组织样本经新鲜冷冻处理，提取DNA后扩增16S基因V3-V4区域。文库使用Zymo Quick-16S V3V4 Plus试剂盒制备，并在Illumina MiSeq平台测序。分析微生物组成以考察其与肿瘤状态及祖先的关联。遗传祖先通过ADMIXTURE分析（v1.3.0）基于1000 Genomes Project参考群体推断。本研究旨在提高非洲祖先群体在结直肠癌相关微生物组研究中的代表性。
【主题与分类】
主题标签：Raw sequence reads。本站分类：肿瘤/其他。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1336699
下载信息
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数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1336699
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集包含来自以非洲遗传 ancestry 为主的大肠癌患者的配对肿瘤及邻近非肿瘤结肠组织样本的16S rRNA基因测序。组织样本经新鲜冷冻处理，提取DNA用于扩增16S基因的V3-V4区域。文库采用Zymo Quick-16S V3V4 Plus试剂盒制备，并在Illumina MiSeq平台上进行测序。通过分析微生物组成，探究其与肿瘤状态及遗传 ancestry 的关联。遗传 ancestry 基于1000 Genomes Project的参考人群，运用ADMIXTURE分析（v1.3.0）推断。本研究旨在增加非洲 ancestry 人群在大肠癌相关微生物组研究中的代表性。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
