卡波西肉瘤内皮细胞转化阶段的pre-microRNA特征

源站描述显示,研究利用新型实时 QPCR 方法进行前体 miRNA 谱分析,定义内皮细胞转化至 Kaposi 肉瘤的渐进阶段,并识别肿瘤进展的生物标志物;比较了患者原发活检与培养及小鼠肿瘤模型,发现 mir-221 缺失和 mir-15 获得标志从永生化到完全致瘤的转变,mir-140 和 KSHV

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2023-05-30 更新
浏览 2
基因组分类pre-micrornasignaturesdelineatestagesendothelialkaposisarcoma
Pre-Micro RNA Signatures Delineate Stages of Endothelial Cell Transformation in Kaposi Sarcoma

基本信息

模态
基因组
大小
0.00887017 GB
任务类型
分类
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2023-05-30
版本
v1

资源简介

卡波西肉瘤内皮细胞转化阶段的pre-microRNA特征

Pre-Micro RNA Signatures Delineate Stages of Endothelial Cell Transformation in Kaposi Sarcoma

该数据集来自 plos.figshare.com,包含 5 个文件(Figure_S1.tif 至 Figure_S4.tif 及 Table_S1.doc),配套论文发表于 PLoS Pathogens(2009 年)。源站描述显示,研究利用新型实时 QPCR 方法进行前体 miRNA 谱分析,定义内皮细胞转化至 Kaposi 肉瘤的渐进阶段,并识别肿瘤进展的生物标志物;比较了患者原发活检与培养及小鼠肿瘤模型,发现 mir-221 缺失和 mir-15 获得标志从永生化到完全致瘤的转变,mir-140 和 KSHV 病毒 miRNA 随转化程度线性增加,mir-24 为 KS 特异性生物标志物。数据可用于 miRNA 标志物分类与。

【数据集背景】

配套论文《Pre-Micro RNA Signatures Delineate Stages of Endothelial Cell Transformation in Kaposi Sarcoma》发表于 PLoS Pathogens(2009),DOI:10.1371/journal.ppat.1000389。源站首次发布:2009-04-17。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):MicroRNAs (miRNA) 已成为细胞谱系分化和癌症的关键调控因子。我们使用一种新型实时 QPCR 方法进行前体 miRNA 谱分析,(i) 以定义内皮细胞转化的渐进阶段,这些阶段累积形成 Kaposi 肉瘤 (KS),(ii) 以识别可作为肿瘤进展生物标志物的特定 miRNA。我们能够将患者原发活检与成熟的培养和小鼠肿瘤模型进行比较。mir-221 的缺失和 mir-15 的表达获得标志着从仅永生化向完全致瘤性内皮细胞的转变。Mir-140 和 Kaposi 肉瘤相关疱疹病毒病毒 miRNA 随转化程度线性增加。Mir-24 成为 KS 特异性的生物标志物。

【数据结构与技术规格】

文件数 5 个,合计 8.87 MB。数据集 DOI:10.1371/journal.ppat.1000389。

【主题与分类】

源站学科分类:Cancer、Mental Health。主题标签:pre-micro、rna、signatures、delineate、stages、endothelial、kaposi、sarcoma。本站分类:肿瘤。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Cancer、Mental Health。

【获取与许可】

源站页面:https://plos.figshare.com/articles/dataset/Pre_Micro_RNA_Signatures_Delineate_Stages_of_Endothelial_Cell_Transformation_in_Kaposi_Sarcoma/147942

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:J. O'Hara, Andrea; Chugh, Pauline; Wang, Ling; M. Netto, Eduardo; Luz, Estrella; J. Harrington Jr., William; et al. (2016). Pre-Micro RNA Signatures Delineate Stages of Endothelial Cell Transformation in Kaposi Sarcoma. PLOS Pathogens. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-05-30,引用时请注意版本时效。

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curl -L -o "Figure_S3.tif" "https://ndownloader.figshare.com/files/446318"
curl -L -o "Figure_S4.tif" "https://ndownloader.figshare.com/files/446353"
curl -L -o "Table_S1.doc" "https://ndownloader.figshare.com/files/446381"

文件清单

  • Figure_S1.tif(1.93 MB)
  • Figure_S2.tif(2.66 MB)
  • Figure_S3.tif(2.26 MB)
  • Figure_S4.tif(1.94 MB)
  • Table_S1.doc(81.41 KB)

文件总体积 8.87 MB(源站 API 实测)。

数据说明

MicroRNAs(miRNA)已成为细胞谱系分化和癌症的关键调控因子。我们采用一种新型实时定量PCR方法进行前体miRNA谱分析,(i) 以界定内皮细胞转化的渐进阶段——这些阶段最终累积形成卡波西肉瘤(KS),(ii) 以鉴定可作为肿瘤进展生物标志物的特定miRNA。我们得以将原发患者活检样本与成熟的培养模型和小鼠肿瘤模型进行比较。mir-221的缺失和mir-15表达的增加标志着从仅永生化向完全致瘤性内皮细胞的转变。Mir-140和卡波西肉瘤相关疱疹病毒viral miRNA随转化程度呈线性增加。Mir-24成为KS特异性的生物标志物。

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.1371/journal.ppat.1000389(source: https://plos.figshare.com/articles/dataset/Pre_Micro_RNA_Signatures_Delineate_Stages_of_Endothelial_Cell_Transformation_in_Kaposi_Sarcoma/147942)。

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