Medulloblastoma 磷酸化蛋白质组学分析

Phosphoproteomics analysis of Medulloblastoma 是一个面向肿瘤研究领域的公开数据集,英文名称即为该数据集的正式标识

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时间序列肿瘤其他磷酸化蛋白质组学MedulloblastomaPRIDE
Phosphoproteomics analysis of Medulloblastoma

基本信息

模态
时间序列
创建/更新时间
2026-10-27

资源简介

Medulloblastoma 磷酸化蛋白质组学分析

Phosphoproteomics analysis of Medulloblastoma 是一个面向肿瘤研究领域的公开数据集,英文名称即为该数据集的正式标识。该数据集来源于 ebi.ac.uk,由 Vanessa Masson 于 2025 年发布,主题涵盖肿瘤方向,在本站分类中归属于“肿瘤 / 其他”类别。作为蛋白质组学与肿瘤研究交叉领域的公开资源,该数据集围绕髓母细胞瘤(Medulloblastoma)的磷酸化蛋白质组学分析展开,为相关研究人员提供了一个可公开访问的数据入口。整体而言,该数据集属于肿瘤领域公开数据集,主题涵盖肿瘤,适合作为髓母细胞瘤磷酸化蛋白质组研究的基础数据资源加以利用。

【数据集背景】

该数据集的英文名称为 Phosphoproteomics analysis of Medulloblastoma,从名称可以看出其研究主题聚焦于髓母细胞瘤的磷酸化蛋白质组学分析。髓母细胞瘤是儿童常见的恶性脑肿瘤之一,针对其蛋白质磷酸化修饰的系统性分析有助于理解肿瘤发生发展相关的信号通路与调控机制。该数据集由 Vanessa Masson 于 2025 年发布,属于肿瘤研究领域的公开数据集,在本站分类体系中归入“肿瘤 / 其他”类别。数据集的发布体现了肿瘤蛋白质组学数据共享的趋势,为相关领域研究者提供了可追溯、可引用的数据来源。

【数据内容】

该数据集的主题涵盖肿瘤,具体内容为髓母细胞瘤的磷酸化蛋白质组学分析数据。关于数据的具体样本数量、磷酸化肽段鉴定数目、覆盖的蛋白数量、实验分组设计等细节,源站未提供。数据集在本站被归类为“肿瘤 / 其他”,表明其属于肿瘤相关数据资源中的一个子类。除上述信息外,数据内容的具体构成、文件格式与数据组织方式,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 ebi.ac.uk,即欧洲生物信息研究所(EBI)的公开数据平台,其源站描述中给出的数据集页面地址为 https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD053675,表明该数据集通过 PRIDE 蛋白质组学数据仓库对外发布。数据集的发布者为 Vanessa Masson,发布年份为 2025 年。关于样本采集的具体来源、实验平台、仪器型号、试剂与处理流程等采集细节,源站未提供。

【适用场景】

该数据集属于肿瘤领域公开数据集,主题涵盖肿瘤,适用于髓母细胞瘤磷酸化蛋白质组学相关的分析与研究场景。研究人员可将其作为肿瘤磷酸化蛋白质组数据的参考资源,用于相关主题的探索性分析。关于该数据集具体的适用分析类型、可支持的科研问题范围等,源站未提供。

【使用方法】

该数据集通过 ebi.ac.uk 平台对外公开,用户可依据源站描述中给出的项目地址访问该数据集页面。关于数据下载方式、文件格式说明、数据处理与分析的具体操作步骤,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为公开数据集,来源于 ebi.ac.uk,发布者为 Vanessa Masson,发布年份为 2025 年。关于数据的质量控制指标、完整性评估、覆盖度、潜在偏差及使用限制等具体信息,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集的引用信息为:Vanessa Masson (2025). Phosphoproteomics analysis of Medulloblastoma [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD053675。关于该数据集的许可条款与使用授权范围,源站未提供。

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源站:https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD053675

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Vanessa Masson (2025). Phosphoproteomics analysis of Medulloblastoma [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD053675

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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