结核菌感染巨噬细胞非编码RNA测序分析

该数据集包含来自未感染和结核菌感染28天后的C57BL/6小鼠肺组织的非编码RNA(miRNA)测序数据,数据模态为基因表达谱,主要用于研究结核菌感染过程中宿主免疫调控的分子机制,特别是非编码RNA在病原体-宿主互作中的作用,为感染免疫学提供基础数据支持。

同济大学同济大学
国家基础学科公共科学数据中心
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结核菌感染非编码RNA测序

基本信息

创建/更新时间
2026-09-06

资源简介

该数据集是面向结核菌感染致病的新型宿主免疫蛋白分子机制研究而构建的。数据包含3个未感染野生型C57BL/6小鼠肺组织样本和3个感染结核菌H37Rv(CFU=200)28天后的C57BL/6小鼠肺组织样本,使用Illumina测序仪进行测序,并经过图像分析、碱基调用和质量过滤处理,最终生成miRNA的原始表达水平数据,数据量为60.73KB。主要研究方向包括结核菌感染的免疫调控机制、非编码RNA在宿主-病原体互作中的作用等。

原始链接

https://www.nbsdc.cn/general/dataDetail?id=64ef83d6bb16e0591d024ca3&type=1

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数据说明

该数据集是面向结核菌感染致病的新型宿主免疫蛋白分子机制研究而构建的。数据包含3个未感染野生型C57BL/6小鼠肺组织样本和3个感染结核菌H37Rv(CFU=200)28天后的C57BL/6小鼠肺组织样本,使用Illumina测序仪进行测序,并经过图像分析、碱基调用和质量过滤处理,最终生成miRNA的原始表达水平数据,数据量为60.73KB。主要研究方向包括结核菌感染的免疫调控机制、非编码RNA在宿主-病原体互作中的作用等。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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