基本信息

模态

基因组

任务类型

分类

创建/更新时间

2026-10-07

资源简介

PDC：KNCC 髓母细胞瘤

PDC: KNCC Medulloblastoma 是一个面向肿瘤研究领域的公开蛋白质组学数据集，归属于国际癌症蛋白质基因组联盟（International Cancer Proteogenome Consortium）相关项目体系。该数据集以髓母细胞瘤为核心主题，来源于 proteomic.datacommons.cancer.gov，属于癌症蛋白质组学数据资源的一部分。从整体定位看，它服务于肿瘤学、蛋白质组学及相关交叉领域的研究人员，用于支持对髓母细胞瘤这一类肿瘤的蛋白质层面数据探索与分析。数据集在分类上归入肿瘤/其他，主题标签包括 International Cancer Proteogenome Consortium，并涉及肿瘤、其他、蛋白质组学、髓母细胞瘤等关键词。整体而言，该数据集为公开可获取的肿瘤蛋白质组学资源，适合作为髓母细胞瘤相关研究的数据参考。

【数据集背景】

该数据集对应的项目名称为 KNCC Medulloblastoma，所属计划为 International Cancer Proteogenome Consortium。其来源站为 proteomic.datacommons.cancer.gov，属于癌症蛋白质组学数据平台中的项目数据。髓母细胞瘤是肿瘤研究中的一个特定主题，而该数据集以蛋白质组学为数据组织方式，面向肿瘤领域公开共享。数据集的主题标签明确指向 International Cancer Proteogenome Consortium，说明其处于国际癌症蛋白质基因组联盟相关工作的框架之下。该数据集在分类上被归为肿瘤/其他，主题涵盖肿瘤，并涉及蛋白质组学与髓母细胞瘤。关于该项目的具体发起机构、合作单位、项目周期、样本规模等更细的背景信息，源站未提供。

【数据内容】

该数据集属于癌症蛋白质组学数据集，来源站描述中将其标识为 PDC/CPTAC 相关数据。其主题标签包括 International Cancer Proteogenome Consortium，并涉及肿瘤、其他、蛋白质组学、髓母细胞瘤。由此可知，数据集内容围绕髓母细胞瘤的蛋白质组学展开，属于肿瘤蛋白质组学数据范畴。关于具体包含的样本数量、蛋白质鉴定数量、定量指标、临床注释字段、组学层次、数据文件格式与体积等信息，源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 proteomic.datacommons.cancer.gov，项目名称为 KNCC Medulloblastoma，所属计划为 International Cancer Proteogenome Consortium。来源站将其描述为 PDC project KNCC Medulloblastoma，并标注为癌症蛋白质组学数据集（PDC/CPTAC）。关于样本采集地点、采集时间、采集流程、伦理审批信息、样本处理与质控方法等，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于肿瘤学与蛋白质组学相关的研究场景，尤其是围绕髓母细胞瘤的蛋白质层面探索。由于其归属于 International Cancer Proteogenome Consortium 相关项目，并属于癌症蛋白质组学数据，可作为肿瘤蛋白质组学分析、髓母细胞瘤主题研究以及相关数据整合工作的参考资源。关于具体的适用分析类型、可支持的科研问题、是否适合临床决策或诊断用途等，源站未提供。

【使用方法】

该数据集为公开数据集，可通过来源站 proteomic.datacommons.cancer.gov 获取。关于具体的下载方式、访问权限、数据检索路径、所需工具、分析流程与使用步骤等，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为肿瘤领域公开数据集，主题涵盖肿瘤，并涉及蛋白质组学与髓母细胞瘤。关于数据质量评估指标、完整性、准确性、批次效应、样本代表性、使用限制与注意事项等，源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来源于 proteomic.datacommons.cancer.gov，项目名称为 KNCC Medulloblastoma，所属计划为 International Cancer Proteogenome Consortium。关于具体的引用格式、许可协议、使用条款与署名要求等，源站未提供。

原始链接

https://proteomic.datacommons.cancer.gov/pdc/study/bc364a56-2b3c-4799-aa8a-bb11d70a77c5

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

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数据集获取

源站：https://proteomic.datacommons.cancer.gov/pdc/study/bc364a56-2b3c-4799-aa8a-bb11d70a77c5

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

PDC project KNCC Medulloblastoma. Program: International Cancer Proteogenome Consortium. Cancer proteomics dataset (PDC/CPTAC).

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别