锆(IV)接枝介孔二氧化硅富集血清内源性磷酸肽深度分析

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD045146

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

在本研究中，我们开发了一种利用锆(IV)接枝介孔珠富集磷酸肽的方法，并结合高分辨率纳升液相色谱-串联质谱系统进行分析。该新方法首先使用标准磷酸化蛋白的胰蛋白酶消化物和HeLa细胞裂解液进行测试，取得了优异的富集效果。该方法进一步应用于胰腺导管腺癌(PDAC)患者和对照组血清样本的内源性磷酸化肽组学分析。总共在样本中鉴定出329种内源性磷酸肽(包含113个高置信度位点)，这是迄今为止 catalogued 的最大内源性磷酸化数据集。此外，该方法还 readily 应用于同一组样本的磷酸化蛋白质组学，鉴定出172种磷酸肽，并观察到数十种磷酸肽的显著变化。综上所述，该方法可作为分析血清磷酸化事件的基准。

鉴于所提出方法的简便性和稳健性，我们设想它能便捷地应用于血清及其他生物体液样本的全面磷酸化研究（即同时进行内源性磷酸肽组学和磷酸蛋白质组学分析）。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。