幼儿新诊断中枢神经系统肿瘤的遗传学研究

疾病:中枢神经系统胚胎性肿瘤。目标: 通过微阵列基因芯片分析,识别在新诊断的转移性与非转移性胚胎性中枢神经系统肿瘤婴儿中表达水平显著不同的已知基因

Pediatric Brain Tumor ConsortiumPediatric Brain Tumor Consortium
clinicaltrials
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基因组分类中枢神经系统胚胎性肿瘤基因表达微阵列基因芯片蛋白质表达转移血管生成聚合酶链反应
Genetic Study of Newly Diagnosed Central Nervous System Tumors in Young Children

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-28

资源简介

幼儿新诊断中枢神经系统肿瘤的遗传学研究

该数据集英文名为 Genetic Study of Newly Diagnosed Central Nervous System Tumors in Young Children,来源于 clinicaltrials.gov,在本站归入肿瘤 / 其他分类,主题标签为中枢神经系统胚胎性肿瘤。其核心内容围绕一项多中心研究展开:通过微阵列基因芯片分析,比较新诊断的转移性与非转移性胚胎性中枢神经系统肿瘤婴儿中基因表达水平的差异,识别表达显著不同的已知基因,并进一步评估相关基因的蛋白质表达及基因表达数量。数据集整体呈现的是该研究的研究对象、研究目标与分析流程信息,面向对儿童中枢神经系统肿瘤分子机制感兴趣的科研与临床人员。

【数据集背景】

该数据集对应的研究关注新诊断中枢神经系统肿瘤的幼儿群体,具体疾病条件为中枢神经系统胚胎性肿瘤。研究旨在从基因表达层面探索婴儿胚胎性中枢神经系统肿瘤在转移性与非转移性之间的分子差异,为理解该类肿瘤的生物学行为提供线索。数据集以 clinicaltrials.gov 的登记信息为来源,属于肿瘤领域中与其他类别并列收录的资源。

【数据内容】

数据集所涉及的内容包括研究目标与分析对象。研究目标主要有三项:其一,利用微阵列基因芯片分析,识别在新诊断的转移性与非转移性胚胎性中枢神经系统肿瘤婴儿中表达水平显著不同的已知基因;其二,确定经微阵列分析识别出的、参与调控血管生成、侵袭或转移等细胞功能的基因在该患者群体中的蛋白质表达;其三,使用半定量聚合酶链反应确定经确认发生翻译表达的基因的基因表达数量。主题标签为中枢神经系统胚胎性肿瘤,源站描述中的疾病条件亦指向该肿瘤类型。

【采集与来源】

该数据集来源于 clinicaltrials.gov。源站描述表明这是一项多中心研究,肿瘤样本通过微阵列基因芯片分析进行处理,差异表达的基因再通过标准免疫组织化学和/或蛋白质印迹分析评估蛋白质表达,基因表达则进一步被量化。数据集的采集对象为新诊断中枢神经系统肿瘤的幼儿,具体为中枢神经系统胚胎性肿瘤患者。除上述来源与流程信息外,源站未提供更细的采集时间、样本量或机构名单等信息。

【适用场景】

该数据集适用于关注儿童中枢神经系统胚胎性肿瘤分子特征的研究场景,例如了解转移性与非转移性肿瘤在基因表达上的差异、关注血管生成与侵袭转移相关基因的蛋白质表达分析,以及需要参考半定量聚合酶链反应进行基因表达定量的研究设计。也可作为肿瘤分类下相关主题资源的检索入口,供临床科研人员了解该多中心研究的总体框架。

【使用方法】

源站未提供具体的数据使用方式、访问权限或分析工具说明。依据源站描述,可了解该研究的分析路径为:肿瘤样本经微阵列基因芯片分析获得差异表达基因,随后以免疫组织化学和/或蛋白质印迹评估蛋白质表达,并以半定量聚合酶链反应对基因表达作进一步定量。使用者可据此理解数据所对应的研究流程,但具体数据获取与操作方式需另行查询源站。

【质量与限制】

源站未提供关于数据质量、完整性或验证情况的说明。已知限制在于,源站描述文本在基因表达进一步定量的部分出现截断,未能呈现完整表述;此外,数据集未提供样本规模、随访信息或统计方法等细节。使用者应注意该数据集为研究登记信息,而非完整的原始检测数据。

【引用与许可】

源站未提供引用格式与许可条款信息。使用时应以 clinicaltrials.gov 的原始登记记录为准,并遵循来源站的相关使用规定。

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源站:https://clinicaltrials.gov/study/NCT00010114

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

疾病:中枢神经系统胚胎性肿瘤。目的:* 通过微阵列基因芯片分析,识别在新诊断的转移性与非转移性胚胎性中枢神经系统肿瘤婴儿中表达水平有显著差异的已知基因。* 确定微阵列分析所识别的、参与调节血管生成、侵袭或转移的细胞功能基因在该患者群体中的蛋白质表达。* 使用半定量聚合酶链反应确定经确认的翻译表达基因的基因表达量。概要:这是一项多中心研究。肿瘤样本通过微阵列基因芯片分析进行分析。对差异表达基因通过标准免疫组织化学和/或Western印迹分析评估蛋白质表达,并通过半定量聚合酶链反应进一步量化基因表达。预计入组:本研究将在4-5年内入组约80-100名患者(20-25名转移性疾病患者和60-75名非转移性疾病患者)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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