致癌EBV感染细胞中的EBV iPOND

该数据集来自omicsdi.org,聚焦致癌性Epstein-Barr病毒(EBV)感染细胞中的蛋白质组学研究。数据描述了EBV在病毒复制叉处改变蛋白质组,突出鉴定出染色质修饰与转录抑制相关蛋白,并涉及EA-D的SUMO化、KAP1-TRIM28、ATM、RECQ5、CAF1与SETDB1等因子在从

omicsdi
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基因组Proteomics
EBV iPOND in cancer-causing Epstein-Barr virus infected cells

基本信息

模态
基因组
创建/更新时间
2026-11-04

资源简介

致癌EBV感染细胞中的EBV iPOND

该数据集来自omicsdi.org,聚焦致癌性Epstein-Barr病毒(EBV)感染细胞中的蛋白质组学研究。数据描述了EBV在病毒复制叉处改变蛋白质组,突出鉴定出染色质修饰与转录抑制相关蛋白,并涉及EA-D的SUMO化、KAP1-TRIM28、ATM、RECQ5、CAF1与SETDB1等因子在从转录向复制转换中的作用。可用于研究DNA病毒在转录与复制交接过程中的DNA修复、表观遗传及转录-复制干扰通路(来源 omicsdi.org)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):我们描述了致癌性Epstein-Barr病毒(EBV),一种原型疱疹病毒,如何在病毒复制叉处改变蛋白质组,突出鉴定出染色质修饰和转录抑制蛋白。具体而言,为了从转录转换,病毒DNA聚合酶持续合成因子EA-D被转录辅阻遏物KAP1-TRIM28 SUMO化。KAP1功能由PI3K相关激酶ATM和解旋酶RECQ5在转录机器处通过磷酸化触发。SUMO-EA-D招募组蛋白装载因子CAF1和甲基转移酶SETDB1以沉默亲本基因组,优先进行复制。因此,DNA修复、表观遗传和转录-复制干扰通路协调从转录到复制的交接,这是DNA病毒的一个基本特征

【主题与分类】

主题标签:Proteomics。本站分类:肿瘤。

【获取与许可】

源站页面:https://omicsdi.org/dataset/massive/MSV000091375

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们描述了致癌的EB病毒(EBV),一种原型疱疹病毒,如何在病毒复制叉处改变蛋白质组,显著识别出染色质修饰和转录抑制蛋白。具体而言,为了从转录过渡,病毒DNA聚合酶持续合成因子EA-D被转录辅阻遏物KAP1-TRIM28 SUMO化。KAP1的功能由PI3K相关激酶ATM和解旋酶RECQ5在转录机制上的磷酸化触发。SUMO化的EA-D招募组蛋白装载因子CAF1和甲基转移酶SETDB1来沉默亲本基因组,优先进行复制。因此,DNA修复、表观遗传和转录-复制干扰途径协调了从转录到复制的交接,这是DNA病毒的一个基本特征。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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