E-GEOD-81089：199例非小细胞肺癌患者及19例配对正常肺组织的RNA-seq

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E-GEOD-81089：199例非小细胞肺癌患者及19例配对正常肺组织的RNA-seq

E-GEOD-81089 是一项针对非小细胞肺癌的 RNA-seq 表达数据集，涵盖 199 位非小细胞肺癌患者以及 19 份配对正常肺组织样本。该数据集来源于 ebi.ac.uk，属于 Expression Atlas 中的差异表达实验，物种为 Homo sapiens。其核心价值在于为肿瘤与配对正常肺组织之间的基因表达比较提供数据基础，可用于差异表达分析、肿瘤分子特征探索以及潜在生物标志物发现等研究方向。数据集在分类上归属于肿瘤 / 其他，主题标签为 Differential，提示其重点在于比较不同条件之间的表达差异，而非单纯的表达谱展示。整体而言，该数据集面向肺癌转录组研究，适合需要肿瘤与正常组织配对比较的科研场景。

【数据集背景】

非小细胞肺癌是肺癌的主要类型之一，其分子机制复杂，涉及基因表达层面的广泛改变。理解肿瘤组织与正常肺组织之间的表达差异，是揭示肿瘤发生发展机制、寻找潜在分子标志物的重要途径。E-GEOD-81089 正是在这一研究背景下产生的 RNA-seq 数据集，聚焦于非小细胞肺癌患者样本与配对正常肺组织的表达比较。该数据集被收录于 Expression Atlas，并以差异表达实验的形式呈现，说明其设计目的侧重于条件间的表达差异分析。来源站为 ebi.ac.uk，物种为 Homo sapiens，主题标签为 Differential，这些信息共同界定了该数据集在肿瘤转录组研究中的基本定位。

【数据内容】

该数据集包含 199 位非小细胞肺癌患者的 RNA-seq 数据，以及 19 份配对正常肺组织样本。所谓配对正常肺组织，通常指来自同一患者的非肿瘤肺组织，用于与肿瘤组织进行配对比较，从而减少个体间差异对表达分析的影响。数据集的核心内容为 RNA-seq 表达信息，可用于比较肿瘤与配对正常肺组织之间的基因表达差异。来源站描述将其归类为 Expression Atlas experiment (Differential)，主题标签为 Differential，进一步表明该数据集的主要数据形态是差异表达相关结果或可用于差异表达分析的表达数据。除上述样本数量与数据类型外，源站未提供更详细的基因层面、转录本层面或临床层面的具体内容。

【采集与来源】

该数据集来源于 ebi.ac.uk，属于 Expression Atlas 中的一项实验。源站描述明确其物种为 Homo sapiens，实验类型为 Differential，样本包括 199 位非小细胞肺癌患者和 19 份配对正常肺组织。关于具体的采样地点、采样时间、测序平台、建库方法、测序深度、读长以及数据处理流程等采集与实验细节，源站未提供。因此，本数据集在采集与来源方面可确认的信息主要限于其来源站点、所属数据库、物种、实验类型以及样本构成。

【适用场景】

根据侧写线索，该数据集可用于比较肿瘤与配对正常肺组织之间的基因表达差异，支持差异表达分析、肿瘤分子特征探索及潜在生物标志物发现等研究。具体而言，研究者可利用该数据集探索非小细胞肺癌中表达上调或下调的基因，分析肿瘤与正常组织之间的转录组差异，并在此基础上筛选可能与肿瘤发生、发展或分型相关的候选分子。由于数据集包含配对正常肺组织样本，其设计有助于进行配对比较分析，从而在一定程度上控制个体差异带来的干扰。该数据集适用于肿瘤转录组学、差异表达分析以及生物标志物发现等研究方向。

【使用方法】

该数据集可通过来源站 ebi.ac.uk 获取，属于 Expression Atlas 中的差异表达实验。使用者可根据 Expression Atlas 的常规访问方式查询该实验，并获取相应的表达与差异分析结果。由于源站未提供具体的下载格式、文件结构、分析参数或代码示例，关于如何具体读取、处理和分析该数据集的操作细节，源站未提供。一般而言，使用此类数据时可结合差异表达分析流程，对肿瘤与配对正常肺组织进行比较，但具体方法需依据源站提供的实际数据与文档进行。

【质量与限制】

该数据集包含 199 位非小细胞肺癌患者和 19 份配对正常肺组织样本，样本数量在肿瘤转录组研究中具有一定规模，且配对设计有助于减少个体间差异。然而，关于数据质量的具体指标，如测序深度、比对率、重复性、批次效应控制以及样本纳入排除标准等，源站未提供。此外，该数据集仅涵盖非小细胞肺癌患者与配对正常肺组织，未提供其他癌种或非配对正常样本的信息。其主题标签为 Differential，说明其主要面向差异表达分析，但是否适合其他类型的分析，源站未提供明确说明。因此，在使用该数据集时，应结合源站提供的原始描述与数据文档，谨慎评估其适用范围与局限性。

【引用与许可】

该数据集来源于 ebi.ac.uk，属于 Expression Atlas 中的实验数据。关于该数据集的具体引用方式、文献出处、作者列表以及许可协议等信息，源站未提供。使用者在引用或再利用该数据集时，应访问来源站 ebi.ac.uk 查阅该实验对应的官方页面，以获取准确的引用要求与许可条款。