E-GEOD-48230：转录因子OVOL1和OVOL2诱导人癌症中的间质向上皮转化
数据覆盖人类癌症中OVOL1和OVOL2介导的间质向上皮转化过程，可用于研究这两个转录因子在肿瘤细胞上皮-间质可塑性中的调控作用及相关差异表达分析（来源 ebi.ac.uk）
基本信息
资源简介
E-GEOD-48230：转录因子OVOL1和OVOL2诱导人癌症中的间质向上皮转化
E-GEOD-48230 是一个来源于 Expression Atlas 的差异表达实验数据集，物种为 Homo sapiens，主题围绕转录因子 OVOL1 和 OVOL2 在人类癌症中诱导间质向上皮转化（mesenchymal to epithelial transition）的过程。该数据集可用于研究这两个转录因子在肿瘤细胞上皮-间质可塑性中的调控作用，并支持相关的差异表达分析。数据集英文全称为“E-GEOD-48230: Transcription factors OVOL1 and OVOL2 induce the mesenchymal to epithelial transition in human cancer”，来源站为 ebi.ac.uk，在本站归类于肿瘤 / 其他。整体而言，该数据集聚焦于肿瘤生物学中转录因子调控细胞状态转变的分子机制，适合作为差异表达与功能调控研究的参考资源。
【数据集背景】
该数据集的主题为转录因子 OVOL1 和 OVOL2 诱导人类癌症中的间质向上皮转化。间质向上皮转化是上皮-间质可塑性的一种重要表现，与肿瘤细胞状态改变和调控机制研究密切相关。OVOL1 和 OVOL2 作为转录因子，在该过程中被描述为具有诱导作用。数据集来源于 Expression Atlas 实验，属于 Differential 类型，物种为 Homo sapiens。本站将其归类为肿瘤 / 其他，主题标签为 Differential。上述信息构成了该数据集的核心背景，即围绕人类癌症中 OVOL1 和 OVOL2 介导的间质向上皮转化过程展开差异表达研究。
【数据内容】
该数据集为 Expression Atlas 实验（Differential），物种为 Homo sapiens。其内容覆盖人类癌症中 OVOL1 和 OVOL2 介导的间质向上皮转化过程，可用于研究这两个转录因子在肿瘤细胞上皮-间质可塑性中的调控作用及相关差异表达分析。数据集英文名称明确指向“Transcription factors OVOL1 and OVOL2 induce the mesenchymal to epithelial transition in human cancer”。主题标签为 Differential，表明其属于差异表达分析类数据。除上述内容外，关于具体样本数量、基因数量、表达矩阵结构、分组方式、统计指标等细节，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ebi.ac.uk。源站描述其为 Expression Atlas experiment (Differential)，物种为 Homo sapiens，主题为“Transcription factors OVOL1 and OVOL2 induce the mesenchymal to epithelial transition in human cancer”。本站分类为肿瘤 / 其他，主题标签为 Differential。关于具体的实验平台、测序或芯片技术、样本采集地点、时间跨度、伦理审批信息、原始数据文件格式等，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于研究人类癌症中 OVOL1 和 OVOL2 两个转录因子在间质向上皮转化过程中的调控作用。具体而言，可用于分析这两个转录因子对肿瘤细胞上皮-间质可塑性的影响，支持差异表达分析，并帮助理解转录因子诱导细胞状态转变的分子机制。由于主题标签为 Differential，该数据集适合用于比较不同条件下基因表达差异的研究场景。关于是否适用于其他癌症类型、其他物种或其他转化过程，源站未提供。
【使用方法】
该数据集来自 Expression Atlas 实验，属于 Differential 类型。使用者可依据 Expression Atlas 的常规使用方式访问该实验，进行差异表达结果的查看与分析。关于具体的下载方式、数据格式、分析工具、参数设置、代码示例或操作步骤，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来源于 ebi.ac.uk 的 Expression Atlas，属于 Differential 实验，物种为 Homo sapiens。其主题明确为 OVOL1 和 OVOL2 诱导人类癌症中的间质向上皮转化。关于数据质量评估指标、批次效应、重复数、统计显著性阈值、假阳性控制、样本量充分性等具体质量信息，源站未提供。关于该数据集在覆盖范围、技术偏差、生物学解释边界等方面的限制，源站未提供。
【引用与许可】
该数据集的来源站为 ebi.ac.uk，源站描述其为 Expression Atlas experiment (Differential)。关于具体的引用格式、文献出处、作者列表、发表年份、许可协议、使用条款或数据共享政策，源站未提供。
下载信息
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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ebi.ac.uk/gxa/experiments/E-GEOD-48230
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Expression Atlas experiment (Differential). Species: Homo sapiens. Transcription factors OVOL1 and OVOL2 induce the mesenchymal to epithelial transition in human cancer
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
