NS398处理与对照HT29结肠腺癌细胞系的表达数据

该数据集来自EBI Expression Atlas的差异表达实验,物种为Homo sapiens,包含NS398处理的HT29结肠腺癌细胞系样本与对照样本的表达数据

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基因组回归Differential
E-GEOD-15799: Expression data from NS398-treated and control HT29 colon adenocarcinoma cell line samples

基本信息

模态
基因组
任务类型
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创建/更新时间
2026-10-30

资源简介

NS398处理与对照HT29结肠腺癌细胞系的表达数据

E-GEOD-15799 是一项来自 EBI Expression Atlas 的差异表达实验数据集,物种为 Homo sapiens,主题标签为 Differential。该数据集收录了经 NS398 处理的 HT29 结肠腺癌细胞系样本与对照样本的表达数据,可用于观察两种条件下细胞系转录水平的差异。数据集英文全称为 Expression data from NS398-treated and control HT29 colon adenocarcinoma cell line samples,在本站归入肿瘤 / 其他分类。整体而言,该数据集围绕结肠腺癌细胞系在药物处理与对照条件下的表达谱对比展开,属于表达谱差异分析类资源,适合作为肿瘤细胞系转录响应研究的参考数据。

【数据集背景】

该数据集来源于 EBI Expression Atlas,属于其中的差异表达实验(Differential)。Expression Atlas 是面向基因表达实验的公共资源,汇集了不同物种、不同实验条件下的表达数据,并提供差异表达结果的组织与展示。本数据集聚焦于人类结肠腺癌细胞系 HT29,比较 NS398 处理样本与对照样本之间的表达差异,主题标签为 Differential,说明其核心用途在于呈现两组条件之间的表达变化,而非单纯的基线表达谱。

【数据内容】

数据集包含 NS398 处理的 HT29 结肠腺癌细胞系样本与对照样本的表达数据。源站描述明确指出,这是来自 NS398-treated 与 control HT29 colon adenocarcinoma cell line 样本的表达数据,物种为 Homo sapiens。数据以差异表达实验的形式组织,主题标签为 Differential。除上述信息外,源站未提供关于样本数量、检测平台、基因数量、差异倍数阈值或具体差异基因列表的进一步说明。

【采集与来源】

该数据集由 EBI Expression Atlas 收录并提供,来源站为 ebi.ac.uk。源站将其标注为 Expression Atlas experiment (Differential),物种为 Homo sapiens,实验材料为 HT29 结肠腺癌细胞系,处理条件为 NS398 处理与对照。关于样本制备、测序或芯片平台、数据处理流程等细节,源站未提供。

【适用场景】

该数据集可用于结肠腺癌细胞系在 NS398 处理条件下表达差异的参考与比较,适合作为差异表达分析、药物处理转录响应研究以及细胞系表达谱对照的辅助资源。由于主题标签为 Differential,其典型用途包括观察处理组与对照组之间的表达变化趋势,以及与其他结肠癌细胞系或药物处理实验进行横向参照。具体分析场景需结合源站提供的实验信息使用。

【使用方法】

使用者可通过 EBI Expression Atlas 获取该实验的差异表达结果与相关表达数据。使用时应注意区分 NS398 处理样本与对照样本两组条件,并结合源站的实验注释理解数据组织方式。关于下载格式、分析工具接口及具体操作步骤,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 EBI Expression Atlas 收录的差异表达实验,物种与细胞系信息明确。但源站未提供样本量、技术重复、统计方法、显著性阈值及数据质控等细节,因此无法据此评估其统计效力与适用范围。使用时应以源站最新注释为准,并注意该数据仅涉及 HT29 单一细胞系,结论外推需谨慎。

【引用与许可】

该数据集来自 EBI Expression Atlas,来源站为 ebi.ac.uk。关于引用方式、许可条款及使用限制,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/gxa/experiments/E-GEOD-15799

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Expression Atlas experiment (Differential). Species: Homo sapiens. Expression data from NS398-treated and control HT29 colon adenocarcinoma cell line samples

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