慢病毒与乙型逆转录病毒表面包膜糖蛋白AlphaFold建模的域组织

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3A8da44922b52f98fc23bb54375848ff7054d17662d0adc69d3ee923f2cd985d05

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

非灵长类慢病毒和β逆转录病毒的表面包膜糖蛋白，在序列上与1型人类免疫缺陷病毒（HIV-1）gp120糖蛋白中面向跨膜糖蛋白的内侧近端结构域β-三明治结构具有相似性，并且其半胱氨酸和糖基化位点分布模式提示，至少在某些慢病毒中存在着类似的双结构域组织。本文展示了通过AlphaFold算法获得的小反刍动物山羊关节炎-脑炎病毒（CAEV）和维斯纳病毒等慢病毒以及β逆转录病毒——绵羊肺腺瘤逆转录病毒（JSRV）、小鼠乳腺肿瘤病毒（MMTV）和共识人类内源性逆转录病毒K型（HERV-K）——的gp135糖蛋白表面糖蛋白的高可靠性模型。这些模型证实并拓展了上述病毒中内侧结构域的结构保守性，并在CAEV和维斯纳病毒gp135中鉴定出两个带有推定受体结合位点的外侧结构域。该位点的位置……

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。