泰国Opisthorchis viverrini流行区尿8-oxodG预测肝胆病理数据

该数据集来自泰国Opisthorchis viverrini流行区的Khon Kaen癌症队列研究,包含四组人群的尿液8-oxodG免疫测定浓度及相关临床信息:O. viverrini阴性个体、无晚期胆管周围纤维化(APF)的阳性个体、有APF的阳性个体以及O. viverrini诱发的胆管癌(CC

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医学影像预测advanced hepatobiliary pathologiesFibrosisurine 8-oxodGCholangiocarcinomachronic inflammation
Data from: Levels of 8-oxodG predict hepatobiliary-pathology in Opisthorchis viverrini endemic settings in Thailand

基本信息

模态
医学影像
大小
0.000017152 GB
任务类型
预测
许可
Creative Commons Zero v1.0 Universal
创建/更新时间
2026-10-24
版本
1

资源简介

泰国Opisthorchis viverrini流行区尿8-oxodG预测肝胆病理数据

Data from: Levels of 8-oxodG predict hepatobiliary-pathology in Opisthorchis viverrini endemic settings in Thailand

该数据集来自泰国Opisthorchis viverrini流行区的Khon Kaen癌症队列研究,包含四组人群的尿液8-oxodG免疫测定浓度及相关临床信息:O. viverrini阴性个体、无晚期胆管周围纤维化(APF)的阳性个体、有APF的阳性个体以及O. viverrini诱发的胆管癌(CCA)病例。数据可用于分析氧化应激标志物8-oxodG与肝胆病理进展的关系,并构建预测模型或评估ROC曲线,以探索8-oxodG在区分不同病理阶段中的潜在价值(来源 DOI 解析,Creative Commons Zero v1.0 Universal 许可)。

【数据集背景】

源站首次发布:2015。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):Opisthorchis viverrini在蠕虫感染中较为特殊,它驱动肝内胆管的慢性炎症反应,从晚期胆管周围纤维化(APF)进展为胆管癌(CCA)。大量研究表明,氧化应激(OS)在从慢性O. viverrini感染向CCA转变的过程中起关键作用。OS还导致修饰的DNA损伤(8-oxodG)被切除进入尿液,其水平可通过免疫测定法检测。在此,我们通过免疫测定法测量了Khon Kaen癌症队列研究中以下四组的尿液8-oxodG浓度:(1)O. viverrini阴性个体,(2)经腹部超声确定无APF的O. viverrini阳性个体,(3)经腹部超声确定有APF的O. viverrini阳性个体,(4)O. viverrini诱发的CCA病例。一项逻辑回归

【主题与分类】

主题标签:advanced hepatobiliary pathologies、Fibrosis、urine 8-oxodG、Cholangiocarcinoma、chronic inflammation。本站分类:肿瘤。

【获取与许可】

源站页面:https://datadryad.org/dataset/doi:10.5061/dryad.pd6mn

使用许可:Creative Commons Zero v1.0 Universal。

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 17.2 KB。

数据说明

麝猫后睾吸虫感染在蠕虫感染中较为特殊,因为它会驱动肝内胆管的慢性炎症反应,从晚期胆管周围纤维化(APF)进展为胆管癌(CCA)。大量研究表明,氧化应激(OS)在慢性麝猫后睾吸虫感染向CCA转变的过程中起关键作用。OS还会导致修饰性DNA损伤产物(8-oxodG)被切除并进入尿液,其水平可通过免疫测定法检测。在本研究中,我们采用免疫测定法检测了孔敬癌症队列研究中以下四组人群的尿8-oxodG浓度:(1)麝猫后睾吸虫阴性个体;(2)经腹部超声确定无APF的麝猫后睾吸虫阳性个体;(3)经腹部超声确定有APF的麝猫后睾吸虫阳性个体;(4)麝猫后睾吸虫诱导的CCA病例。采用逻辑回归模型评估肌酐校正后尿8-oxodG在这些组间的应用价值,同时纳入人口学、行为学和免疫学危险因素。

采用受试者工作特征(ROC)曲线分析评估尿8-oxodG对APF和CCA的预测准确性。尿中8-oxodG浓度升高与APF和CCA呈强剂量依赖性正相关。与无这些病理改变的麝猫后睾吸虫感染者相比,尿8-oxodG浓度也能准确预测个体是否患有APF或CCA。总之,尿8-oxodG是慢性后睾吸虫病进展为APF和CCA的一个可靠的“候选”生物标志物,这表明氧化应激(OS)在这两种晚期肝胆病理中发挥关键作用。这些发现还证实了我们之前的观察结果,即在麝猫后睾吸虫流行区居民中,严重肝脏病理发生较早且无症状,这些居民多年来(通常数十年)感染这种食源性病原体。这些发现

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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