相邻正常结肠组织DNA甲基化组合预测癌症复发：临床队列研究数据

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5061/dryad.pg126

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数据集大小约 31.2 KB。

数据说明

越来越多的证据表明，相同肿瘤分期的患者需要根据分子因素进一步分层。我们评估了癌症分期与DNA甲基化状态的联合作为结直肠癌（CRC）患者复发和死亡风险指标的价值。一项来自台湾三军总医院的215例CRC患者（平均年龄64.32岁；男性占50.5%）的队列研究考察了癌症分期与CRC复发和死亡风险之间的关联。采用Cox比例风险模型分析研究入组时患者的甲基化状态和临床信息及其与随访期间CRC复发和死亡的关系。与肿瘤组织中无甲基化状态的局部期患者相比，p16、hMLH1和MGMT甲基化的晚期患者CRC复发风险更高，调整后的风险比（HR）（95%置信区间[CI]）分别为9.64（2.92–31.81）、8.29（3.40–20.22）和11.83（3.49–40.12）。

在分析正常组织时，我们观察到结直肠癌复发风险相似，校正后的HR（95% CI）分别为10.85（4.06–28.96）、9.04（3.79–21.54）和12.61（4.90–32.44）。在联合分析中，与局部期且未发生甲基化的患者相比，晚期且正常组织和肿瘤组织均存在DNA甲基化的患者复发风险升高，校正后的HR（95% CI）为9.37（3.36–26.09）。在晚期患者中，甲基化状态和组织亚型与5年累积结直肠癌复发风险升高相关（p < 0.001）。本研究表明，根据癌症分期和组织亚型对DNA甲基化状态进行聚类分析对于评估结直肠癌患者的复发风险至关重要，并且还提示了一种潜在机制。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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