完整过渡表位映射分析癌症突变C2H2锌指蛋白连接区磷酸化依赖抗体结合数据集
Michael Kreutzer，通过完整过渡表位映射-热力学弱力序分析表征磷酸化依赖的抗体与癌症突变C2H2锌指蛋白连接区的结合
基本信息
资源简介
完整过渡表位映射分析癌症突变C2H2锌指蛋白连接区磷酸化依赖抗体结合数据集
该数据集英文名称为 Data from: Characterization of Phosphorylation-dependent Antibody Binding to Cancer-mutated Linkers of C2H2 Zinc Finger Proteins by Intact Transition Epitope Mapping - Thermodynamic Weak-force Order Analysis，由 Michael Kreutzer 提交，收录于 ebi.ac.uk（PRIDE 归档，项目编号 PXD035818），本站归类为肿瘤 / 其他。数据集围绕磷酸化依赖的抗体与癌症突变 C2H2 锌指蛋白连接区结合这一主题，采用完整过渡表位映射与热力学弱力序分析相结合的方法进行表征，属于蛋白质组学与肿瘤分子机制交叉方向的研究数据。以下依据可获得的信息，从背景、内容、来源、适用场景、使用方法、质量与限制以及引用与许可等方面进行介绍。
【数据集背景】
C2H2 锌指蛋白是一类广泛参与基因转录调控的蛋白质，其连接区（linker）序列的突变与肿瘤发生相关。磷酸化修饰可能改变连接区的构象与相互作用性质，进而影响抗体对该区域的识别。该数据集所对应的研究旨在表征磷酸化依赖的抗体与癌症突变 C2H2 锌指蛋白连接区之间的结合行为，并借助完整过渡表位映射与热力学弱力序分析手段，从表位定位与弱作用力热力学两个层面刻画这种结合特征。研究由 Michael Kreutzer 完成，数据以数据集形式公开于 PRIDE 归档。
【数据内容】
源站未提供具体文件清单、样本数量、质谱原始文件格式或处理结果表的详细说明。根据数据集标题与源站描述，其内容应涉及完整过渡表位映射实验所产生的数据，以及基于热力学弱力序分析得到的结合表征结果，研究对象为磷酸化依赖的抗体与癌症突变 C2H2 锌指蛋白连接区的相互作用。除上述主题性描述外，源站未提供可进一步引用的数据内容细节。
【采集与来源】
该数据集来源于 ebi.ac.uk，对应 PRIDE 归档项目 PXD035818，提交者为 Michael Kreutzer。源站描述中给出的引用信息为：Michael Kreutzer, Characterization of Phosphorylation-dependent Antibody Binding to Cancer-mutated Linkers of C2H2 Zinc Finger Proteins by Intact Transition Epitope Mapping - Thermodynamic Weak-force Order Analysis. [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD035818。关于具体实验材料、仪器型号、色谱与质谱参数、样品制备流程等采集细节，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于与蛋白质组学、表位定位和蛋白质—抗体相互作用表征相关的研究场景，尤其是关注磷酸化修饰如何影响抗体识别的研究，以及涉及 C2H2 锌指蛋白连接区癌症突变的分子机制探索。由于本站将其归类为肿瘤 / 其他，也可作为肿瘤相关蛋白质相互作用研究的参考数据。方法学上，对完整过渡表位映射与热力学弱力序分析感兴趣的研究者可将其作为方法应用实例。具体适用性需结合源站提供的原始信息判断，源站未提供明确的推荐使用场景说明。
【使用方法】
源站未提供数据下载后的具体使用说明、分析流程或软件参数。使用者可依据 PRIDE 归档项目 PXD035818 的公开页面获取数据及配套信息，并参考原研究的方法描述理解数据组织方式。关于数据解析步骤与复现条件，源站未提供。
【质量与限制】
源站未提供数据质量评估、完整性说明或已知技术限制。该数据集为单一研究项目产生的数据，其结论与适用范围受原研究设计约束；由于缺乏样本规模、重复次数与质控指标等信息，使用者不宜对其统计效力或普适性作出超出源站描述的判断。
【引用与许可】
引用该数据集时，应使用源站描述中给出的引用信息，即 Michael Kreutzer 的上述数据集条目及其 PRIDE 项目链接 https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD035818。关于许可条款与使用限制，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD035818
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Michael Kreutzer, Characterization of Phosphorylation-dependent Antibody Binding to Cancer-mutated Linkers of C2H2 Zinc Finger Proteins by Intact Transition Epitope Mapping - Thermodynamic Weak-force Order Analysis. [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD035818
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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