实验性疟疾相关ARDS血清蛋白质组学数据
主题标签:呼吸道疾病、急性呼吸窘迫综合征、疟疾、血清蛋白质组学、急性期反应蛋白、PRIDE。本站分类:呼吸道疾病/急性呼吸窘迫综合征

基本信息
资源简介
实验性疟疾相关ARDS血清蛋白质组学数据
该数据集为一项关于实验性疟疾相关急性呼吸窘迫综合征的血清蛋白质组学研究数据,英文名称为“Data from: SERUM PROTEOMICS OF Experimental MALARIA-associated ARDS REVEALS A REGULATION OF ACUTE PHASE RESPONSE PROTEINS”。数据集收录于EBI(欧洲生物信息研究所)下属的PRIDE数据库,来源站为ebi.ac.uk。从主题上看,该数据聚焦呼吸道疾病中的急性呼吸窘迫综合征,并关联疟疾感染背景下的血清蛋白质组学分析,重点涉及急性期反应蛋白的调控研究。本站将其归类于“呼吸道疾病 / 急性呼吸窘迫综合征”方向,适合关注疟疾相关肺损伤、急性呼吸窘迫综合征分子机制以及血清蛋白质组学的研究人员参考使用。
【数据集背景】
该数据集来源于一项针对实验性疟疾相关急性呼吸窘迫综合征的血清蛋白质组学研究。急性呼吸窘迫综合征是一种以急性低氧性呼吸衰竭为特征的严重临床综合征,而疟疾作为全球重要的感染性疾病,其与急性呼吸窘迫综合征的关联机制尚需深入探索。该研究通过血清蛋白质组学手段,旨在揭示实验性疟疾相关急性呼吸窘迫综合征中急性期反应蛋白的调控情况。数据集由Simon Mule于2025年提交至PRIDE数据库,项目编号为PXD050496。本站将其归入呼吸道疾病与急性呼吸窘迫综合征分类,便于相关领域研究者检索与利用。
【数据内容】
该数据集的核心内容为血清蛋白质组学数据,主题标签包括呼吸道疾病、急性呼吸窘迫综合征、疟疾、血清蛋白质组学、急性期反应蛋白以及PRIDE。研究聚焦于实验性疟疾相关急性呼吸窘迫综合征模型中血清蛋白质的表达与调控,特别是急性期反应蛋白的变化。数据集以蛋白质组学原始数据形式呈现,具体包含的样本数量、蛋白质鉴定数量、定量结果、差异表达蛋白列表等详细信息,源站未提供。数据内容围绕血清样本的蛋白质组学分析展开,旨在为理解疟疾相关急性呼吸窘迫综合征的病理生理过程提供蛋白质层面的证据。
【采集与来源】
该数据集来源于ebi.ac.uk,具体收录于PRIDE数据库,项目编号为PXD050496。源站描述显示,该数据集由Simon Mule于2025年提交,标题为“SERUM PROTEOMICS OF Experimental MALARIA-associated ARDS REVEALS A REGULATION OF ACUTE PHASE RESPONSE PROTEINS”。数据采集的具体实验设计、样本来源、动物模型或人体样本信息、质谱平台、色谱条件、数据处理流程等,源站未提供。数据集的来源站为ebi.ac.uk,属于公共蛋白质组学数据存储库,用户可通过PRIDE项目页面访问该数据集。
【适用场景】
该数据集适用于多个研究与应用场景。首先,可用于疟疾相关急性呼吸窘迫综合征的分子机制研究,特别是急性期反应蛋白在疾病发生发展中的调控作用。其次,可用于血清蛋白质组学方法学的参考与比较,帮助研究者了解实验性疟疾模型中血清蛋白质组的变化特征。第三,可用于生物标志物发现研究,通过分析急性期反应蛋白的调控模式,筛选潜在的诊断或预后标志物。第四,可用于呼吸道疾病与感染性疾病交叉领域的比较研究,探索疟疾与其他病因所致急性呼吸窘迫综合征在蛋白质层面的异同。第五,可作为蛋白质组学数据再分析的资源,支持meta分析或方法学验证。具体适用场景需结合源站提供的实验设计与数据质量进行评估。
【使用方法】
该数据集可通过ebi.ac.uk的PRIDE数据库项目页面获取,项目编号为PXD050496。用户可根据源站提供的下载链接获取原始数据文件。具体的数据格式、文件类型、下载方式、是否需要注册或遵守特定访问协议等,源站未提供。使用该数据集时,建议参考PRIDE数据库的一般使用规范,并结合源站描述中的研究标题与主题标签理解数据背景。由于源站未提供详细的实验流程与分析参数,用户在再利用数据时需自行评估数据适用性,并可能需要联系数据提交者获取更多技术细节。
【质量与限制】
该数据集的质量控制信息、数据完整性评估、技术重复情况、缺失值处理、归一化方法等,源站未提供。数据限制方面,源站未提供样本量、物种信息、实验条件、统计分析方法等关键细节,因此无法对数据的代表性、可重复性与普适性做出判断。此外,该数据集为实验性疟疾相关急性呼吸窘迫综合征的血清蛋白质组学数据,其结论是否适用于人体临床场景,源站未提供相关信息。用户在使用时应谨慎解读,并结合其他独立研究进行验证。
【引用与许可】
该数据集的引用信息为:Simon Mule (2025). SERUM PROTEOMICS OF Experimental MALARIA-associated ARDS REVEALS A REGULATION OF ACUTE PHASE RESPONSE PROTEINS [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD050496。关于该数据集的许可协议、使用条款、是否允许商业用途、是否需要署名等,源站未提供。用户在引用或再利用该数据集时,应遵循PRIDE数据库的通用引用规范,并直接查阅源站页面获取最新的许可与使用政策。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD050496
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Simon Mule (2025). SERUM PROTEOMICS OF Experimental MALARIA-associated ARDS REVEALS A REGULATION OF ACUTE PHASE RESPONSE PROTEINS [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD050496
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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