CosMx 6000-plex 结肠癌数据集
该数据集为一份 RData 文件,包含 CosMx 数据集中用于 InSituCor 手稿分析的部分内容,聚焦结肠癌。该数据可用于空间转录组学相关分析,尤其是 CosMx 平台下结肠癌组织的基因表达与空间信息研究(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)

基本信息
资源简介
CosMx 6000-plex 结肠癌数据集
CosMx 6000-plex colon cancer dataset
该数据集为一份 RData 文件,包含 CosMx 数据集中用于 InSituCor 手稿分析的部分内容,聚焦结肠癌。数据由 Patrick Danaher 于 2023-09-20 发布,DOI 为 10.6084/m9.figshare.24164388.v1,来源站为 doi.org。文件数量为 1,样例文件名为 colon cancer dataset.RData。该数据可用于空间转录组学相关分析,尤其是 CosMx 平台下结肠癌组织的基因表达与空间信息研究(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。
【数据集背景】
源站首次发布:2023-09-20。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):一个 RData 文件,包含 InSituCor 手稿分析所使用的 CosMx 数据集的部分内容。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 800.68 MB。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.24164388.v1。
【主题与分类】
源站学科分类:Genomics and transcriptomics、Bioinformatic methods development。主题标签:cosmx、spatial transcriptomics technology、colon cancer。本站分类:肿瘤/其他。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Genomics and transcriptomics、Bioinformatic methods development。
【获取与许可】
源站页面:https://figshare.com/articles/dataset/CosMx_6000-plex_colon_cancer_dataset/24164388
使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。
规范引用:Danaher, Patrick (2023). CosMx 6000-plex colon cancer dataset. figshare. Dataset
下载信息
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暂未开放公开下载
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使用方式
数据集获取
源站:https://doi.org/10.6084/m9.figshare.24164388.v1
标准获取流程:
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- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 800.7 MB。
数据说明
一个RData文件,包含InSituCor手稿中分析所使用的CosMx数据集部分。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




