多组学模型用于鼻咽癌早期筛查比较:cfDNA甲基化、EBV DNA与血清双抗体检测

该数据集来自clinicaltrials.gov,聚焦具有中国特色的鼻咽癌(NPC)早期筛查。研究比较多组学模型(如鼻咽癌特异性DNA甲基化、片段组学)与临床常规EBV核酸定量(EBV DNA)及血清双抗体(EBNA1-IgA和VCA-IgA)检测的性能差异,覆盖鼻咽癌患者早期筛查场景,可用于评估不

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clinicaltrials
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基因组分类Nasopharyngeal Carcinoma (NPC)
Comparison of Multi-omics Models for Early Nasopharyngeal Carcinoma Screening: cfDNA Methylation, EBV DNA, and Serological Double-antibodies Detection

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-31

资源简介

多组学模型用于鼻咽癌早期筛查比较:cfDNA甲基化、EBV DNA与血清双抗体检测

该数据集源自 clinicaltrials.gov,聚焦具有中国特色的鼻咽癌(NPC)早期筛查研究。研究围绕多癌种早期筛查模型中对鼻咽癌的早期筛查检测性能展开分析,重点比较多组学模型与临床常规检测手段之间的性能差异。所涉及的多组学模型包括鼻咽癌特异性 DNA 甲基化与片段组学等,对照手段则为临床常规开展的 Epstein-Barr 病毒(EBV)核酸定量(EBV DNA)检测以及血清双抗体(EBNA1-IgA 与 VCA-IgA)检测。研究提示,与 EBV DNA 定量和双抗体检测相比,DNA 甲基化等多组学模型在鼻咽癌患者中可避免假阴性、提高灵敏度,并提升早期鼻咽癌的检出率。该数据集归入肿瘤/其他分类,主题标签为 Nasopharyngeal Carcinoma(NPC),可用于评估相关筛查模型的检测表现。

【数据集背景】

鼻咽癌是具有中国特色的癌种,其早期筛查对改善患者预后具有重要意义。临床上常规开展的筛查手段主要包括 EBV 核酸定量(EBV DNA)检测和血清双抗体检测(EBNA1-IgA 与 VCA-IgA)。本研究关注多癌种早期筛查模型在鼻咽癌早期筛查中的检测性能,并比较鼻咽癌特异性 DNA 甲基化、片段组学等多组学模型与上述临床常规检测之间的性能差异,以探讨多组学方法在避免假阴性、提高灵敏度和提升早期鼻咽癌检出率方面的潜在价值。

【数据内容】

数据集主题标签为 Nasopharyngeal Carcinoma(NPC),所属分类为肿瘤/其他。研究涉及的条件为鼻咽癌(Nasopharyngeal Carcinoma, NPC)。研究所比较的检测类别包括:鼻咽癌特异性 DNA 甲基化、片段组学等多组学模型,以及临床常规的 EBV DNA 定量检测和血清双抗体(EBNA1-IgA 与 VCA-IgA)检测。关于样本量、具体变量字段、检测指标数值等详细数据内容,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源站为 clinicaltrials.gov,其源站描述指向一项针对鼻咽癌的研究,研究内容为分析多癌种早期筛查模型对鼻咽癌的早期筛查检测性能,并比较多组学模型与临床常规 EBV DNA 检测、血清双抗体检测之间的性能差异。关于具体的采集机构、采集时间、采集地点及采集流程,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于鼻咽癌早期筛查相关的研究与评估场景,可用于考察多癌种早期筛查模型中鼻咽癌检测的表现,比较 DNA 甲基化、片段组学等多组学模型与 EBV DNA 定量、血清双抗体检测在灵敏度、假阴性规避及早期鼻咽癌检出率等方面的差异。关于其他具体应用场景,源站未提供。

【使用方法】

源站未提供。

【质量与限制】

源站未提供。

【引用与许可】

源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://clinicaltrials.gov/study/NCT06763289

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

疾病:鼻咽癌(NPC)。本研究聚焦于鼻咽癌这一具有中国特色的癌症类型,分析鼻咽癌在多癌种早期筛查模型中的早期筛查检测性能,并比较鼻咽癌特异性DNA甲基化和片段组学等多组学模型与临床常规开展的Epstein-Barr病毒(EBV)核酸检测(EBV DNA)及血清学双抗体(EBNA1-IgA和VCA-IgA双抗体)检测在多癌种早期筛查模型中的性能差异。研究提示,与EBV DNA定量和双抗体检测相比,在鼻咽癌患者中,DNA甲基化等多组学模型可避免假阴性、提高灵敏度、增加早期鼻咽癌的检出率;在非鼻咽癌患者中,DNA甲基化等多组学模型可避免假阳性、提高特异性、避免不必要的过度诊断。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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