ctDNA甲基化与CEA在结直肠癌中诊断敏感性比较

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT05558436

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

条件：结直肠肿瘤。结直肠癌（CRC）是全球第三大常见癌症，也是第二大致命癌症。据报道，患者更倾向于采用非侵入性方法而非侵入性方法来检测CRC。癌胚抗原（CEA）在临床实践中常用于CRC的早期检测，但其敏感性较低，约为30%-40%，因此应用受限。DNA甲基化是血浆中非侵入性肿瘤检测的常用生物标志物。我们旨在基于全基因组甲基化检测，开发并验证一种基于ctDNA甲基化的血液检测方法用于CRC诊断。该研究分为两个步骤。首先，这项前瞻性研究旨在识别结直肠肿瘤差异性循环肿瘤DNA（ctDNA）甲基化生物标志物，并建立诊断模型。其次，我们进行了一项初步研究，基于差异性生物标志物对早期和晚期疾病进行分层。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。