基于微吸管抽吸的数百个单肿瘤细胞胞质黏度表征
该数据集来自 search.dataone.org,聚焦肿瘤细胞的胞质黏度这一评估细胞骨架状态的关键生物力学参数。数据覆盖 H1299、A549 及骨架受损的药物处理 H1299 细胞,在 -10 kPa 或 -5 kPa 压力下用微吸管连续抽吸,记录抽吸长度随时间的变化,并基于理论牛顿流体模型换算

基本信息
资源简介
基于微吸管抽吸的数百个单肿瘤细胞胞质黏度表征
Characterization of cytoplasmic viscosity of hundreds of single tumor cells based on micropipette aspiration
该数据集来自 search.dataone.org,聚焦肿瘤细胞的胞质黏度这一评估细胞骨架状态的关键生物力学参数。数据覆盖 H1299、A549 及骨架受损的药物处理 H1299 细胞,在 -10 kPa 或 -5 kPa 压力下用微吸管连续抽吸,记录抽吸长度随时间的变化,并基于理论牛顿流体模型换算为胞质黏度。数据可用于单细胞胞质黏度的定量表征、同类型细胞黏度分布分析,以及基于黏度特征的不同细胞类型模式识别分类研究(来源 DataONE,CC0 1.0 Universal (CC0 1.0) Public Domain Dedication 许可)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):背景:胞质黏度(μc)是评估细胞骨架状态的关键生物力学参数。以往研究集中于白细胞,但肿瘤细胞的胞质黏度数据缺失。方法:肿瘤细胞(H1299、A549 及骨架受损的药物处理 H1299)在 -10 kPa 或 -5 kPa 压力下通过微吸管连续抽吸,获得抽吸长度随时间的变化,并基于理论牛顿流体模型换算为胞质黏度。采用四分位离散系数评估同一细胞类型内胞质黏度的分布,同时使用基于神经网络的模式识别根据胞质黏度对不同细胞类型进行分类。结果:单细胞胞质黏度及其三个四分位数和 q
【主题与分类】
主题标签:Micropipette Aspiration、Cytoplasmic Viscosity、Single Tumor Cells、Cellular Biophysics。本站分类:肿瘤。
【获取与许可】
源站页面:https://search.dataone.org/view/sha256%3Aa4fd21a87a8aaffb4e2d0c5b880bfc81f1d22b39cc500cf2af54ca84ef4fb58d
使用许可:CC0 1.0 Universal (CC0 1.0) Public Domain Dedication。
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- OpenDataLab:
数据说明
背景:细胞质黏度(μc)是评估细胞骨架状态的关键生物力学参数。以往研究主要集中于白细胞,而肿瘤细胞的细胞质黏度数据尚属空白。方法:以-10 kPa或-5 kPa的压力将肿瘤细胞(H1299、A549及经药物处理导致细胞骨架受损的H1299)连续吸入微管,获得吸入长度随时间变化的曲线,并基于理论牛顿流体模型将其转化为细胞质黏度。采用四分位离散系数评估同一细胞类型内细胞质黏度的分布,同时利用基于神经网络的模式识别方法,依据细胞质黏度对不同细胞类型进行分类。结果:单细胞细胞质黏度的三个四分位数及四分位离散系数分别为16.7 Pa•S、42.1 Pa•S、110.3 Pa•S和74%(H1……
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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