cBioPortal:甲状腺癌(TCGA,PanCancer Atlas)
该数据集来自 cBioPortal,标题为甲状腺癌(TCGA,PanCancer Atlas),属于肿瘤与其他类别。数据为 TCGA PanCancer 项目中的甲状腺癌数据,源站提供了原始数据与相关出版物的链接

基本信息
资源简介
cBioPortal:甲状腺癌(TCGA,PanCancer Atlas)
cBioPortal 收录的甲状腺癌(TCGA,PanCancer Atlas)数据集,英文名称为 cBioPortal: Thyroid Carcinoma (TCGA, PanCancer Atlas),源站标题为 Thyroid Carcinoma (TCGA, PanCancer Atlas)。该数据集在站内归入肿瘤 / 其他类别,来源站为 cbioportal.org,主题标签为 thpa。其内容为 TCGA PanCancer 项目中的甲状腺癌数据,源站同时提供了原始数据与相关出版物的链接。该数据集可用于了解甲状腺癌在泛癌分析框架下的公开数据资源,相关文献标识符包括 pmid:29625048、29596782、29622463、29617662、29625055、29625050、29617662、30643250、322 等。
【数据集背景】
该数据集属于 TCGA PanCancer Atlas 体系下的甲状腺癌部分。TCGA 即癌症基因组图谱计划,PanCancer Atlas 是在 TCGA 各癌种数据基础上开展的跨癌种整合分析工作。甲状腺癌是 TCGA 所覆盖的癌种之一,本数据集即针对该癌种,以 PanCancer Atlas 的形式在 cBioPortal 上发布。源站描述指出,这是甲状腺癌的 TCGA PanCancer 数据,并给出了原始数据与相关出版物的链接位置。数据集的主题标签为 thpa,站内分类归入肿瘤 / 其他。
【数据内容】
依据源站描述,本数据集的内容为甲状腺癌 TCGA PanCancer 数据。源站标题明确指向 Thyroid Carcinoma(甲状腺癌)与 TCGA、PanCancer Atlas 两个限定语。除上述范围界定外,关于具体的样本数量、组学层次、突变谱、拷贝数变异、表达谱、临床注释字段等细节,源站未提供。因此,本数据集在数据内容层面的具体构成,需以源站页面及其链接的原始数据与出版物为准。
【采集与来源】
该数据集来源于 cbioportal.org,即 cBioPortal 癌症基因组学数据平台。源站描述说明,原始数据可在源站给出的链接处获取,相关出版物亦可通过源站提供的链接查阅。数据集的英文名称中带有 cBioPortal 前缀,表明其在 cBioPortal 上的收录身份。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批、测序平台与处理流程等具体信息,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于甲状腺癌相关的公开数据检索与浏览场景,尤其适合在泛癌分析框架下考察甲状腺癌。由于数据集归入肿瘤 / 其他类别,并带有 thpa 主题标签,可用于按癌种或按主题进行数据发现。对于希望获取 TCGA PanCancer 甲状腺癌原始数据或查阅相关出版物的使用者,源站提供的链接可作为入口。关于该数据集是否适用于特定的统计建模、临床决策或诊断用途,源站未提供说明。
【使用方法】
使用者可通过来源站 cbioportal.org 访问该数据集页面,并依据源站描述中给出的链接获取原始数据与相关出版物。数据集以英文名称 cBioPortal: Thyroid Carcinoma (TCGA, PanCancer Atlas) 标识,检索时可用该名称或源站标题 Thyroid Carcinoma (TCGA, PanCancer Atlas) 定位。关于具体的下载方式、数据格式、接口调用方法及分析工具,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为 TCGA PanCancer 项目中的甲状腺癌数据,经 cBioPortal 收录发布,并附有原始数据与出版物的链接,便于溯源。关于数据质量评估、缺失情况、批次效应、样本代表性及使用限制等,源站未提供。使用者应结合源站链接的原始数据与出版物自行判断适用性。
【引用与许可】
该数据集的相关文献标识符包括 pmid:29625048、29596782、29622463、29617662、29625055、29625050、29617662、30643250、322 等。源站描述中提供了出版物的链接,引用时应以该链接指向的出版物为准。关于数据集的许可条款、使用条件与再分发规定,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://cbioportal.org/study/summary?id=thca_tcga_pan_can_atlas_2018
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Thyroid Carcinoma TCGA PanCancer data. The original data is here . The publications are here .
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