cBioPortal TCGA甲状腺癌
cBioPortal TCGA甲状腺癌是公开可访问数据集,包含TCGA甲状腺癌突变、表达、拷贝数和临床数据等表格数据,围绕甲状腺癌相关临床表现、影像、信号或组学信息,适合用于分类、模型训练、外部验证和疾病机制探索。

基本信息
资源简介
cBioPortal TCGA甲状腺癌
【一句话概览】
TCGA甲状腺癌(Thyroid Carcinoma)数据集,来源于GDAC Firehose,此前称为TCGA Provisional,相关标签为thpa(来源 cBioPortal)。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Thyroid Carcinoma (TCGA, Firehose Legacy)》。
【数据内容】
源站原始描述:TCGA Thyroid Carcinoma. Source data from GDAC Firehose . Previously known as TCGA Provisional
中文译文(机器翻译,仅供快速理解,请以原文为准):TCGA甲状腺癌。数据来源于GDAC Firehose。此前称为TCGA临时版。
【主题与分类】
主题标签:thpa。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面:https://www.cbioportal.org/study/summary?id=thca_tcga
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://www.cbioportal.org/study/summary?id=thca_tcga
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
cBioPortal TCGA甲状腺癌包含TCGA甲状腺癌突变、表达、拷贝数和临床数据等表格数据,可用于甲状腺癌相关分类、诊断建模、分型或外部验证。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
数据缺失?
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