cBioPortal:慢性淋巴细胞白血病(IUOPA,Nature 2015)

该数据集的英文名称中包含 Chronic Lymphocytic Leukemia,指向慢性淋巴细胞白血病;名称与源站标题中同时出现 IUOPA 和 Nature 2015,提示其与相关机构及 2015 年 Nature 发表工作存在关联

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基因组分类cllsll
cBioPortal: Chronic Lymphocytic Leukemia (IUOPA, Nature 2015)

基本信息

模态
基因组
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分类
创建/更新时间
2026-10-01

资源简介

cBioPortal:慢性淋巴细胞白血病(IUOPA,Nature 2015)

cBioPortal: Chronic Lymphocytic Leukemia (IUOPA, Nature 2015) 是发布在 cbioportal.org 的肿瘤相关数据集,源站标题为 Chronic Lymphocytic Leukemia (IUOPA, Nature 2015),当前归类为“肿瘤 / 其他”,主题标记为 cllsll,关联标识为 pmid:26200345,核心内容围绕 CLL、MBL 与 SLL 的肿瘤/正常配对突变数据。

【数据集背景】

该数据集的英文名称中包含 Chronic Lymphocytic Leukemia,指向慢性淋巴细胞白血病;名称与源站标题中同时出现 IUOPA 和 Nature 2015,提示其与相关机构及 2015 年 Nature 发表工作存在关联。CLL 通常指慢性淋巴细胞白血病,MBL 通常指单克隆 B 淋巴细胞增多症,SLL 通常指小淋巴细胞淋巴瘤,这些缩写属于相关淋巴增殖性疾病的常用名称。该数据集在来源站被归入肿瘤相关类别,主题标记为 cllsll。不过,关于该数据集的详细研究背景、发起机构、研究目的、样本招募过程、临床背景及既往研究脉络,源站未提供。因此,这里只能依据源站标题和描述说明其基本定位,不能扩展为对研究设计或科学结论的具体判断。

【数据内容】

根据源站描述,该数据集包含来自全基因组或全外显子测序的突变数据,样本包括 428 例 CLL、54 例 MBL 和 24 例 SLL 的肿瘤/正常配对。也就是说,数据以肿瘤与正常样本配对的形式组织,检测内容聚焦于突变信息;测序策略并非单一,而是全基因组或全外显子测序。除这些信息外,源站未提供突变的具体类型、突变基因列表、变异等位基因频率、拷贝数变异、结构变异、表达数据、甲基化数据、临床注释、随访信息或生存数据等内容。因而,该数据集的核心可见内容集中在 CLL、MBL 和 SLL 相关样本的突变层面,而不是完整的多组学或临床队列描述。

【采集与来源】

数据来源站为 cbioportal.org,源站标题为 Chronic Lymphocytic Leukemia (IUOPA, Nature 2015)。源站描述仅说明其包含 428 例 CLL、54 例 MBL 和 24 例 SLL 的肿瘤/正常配对的全基因组或全外显子测序突变数据。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批、测序平台、建库方法、数据处理流程、变异检出流程及质控标准,源站未提供。该数据集与 cBioPortal 这一癌症基因组数据资源站点相关联,但更细的采集与来源信息需要以源站页面或原始发表文献为准;就现有信息而言,无法进一步说明样本如何入组、如何测序以及如何完成突变 calling。

【适用场景】

该数据集可被用于与慢性淋巴细胞白血病及相关淋巴增殖性疾病突变特征有关的研究场景,例如观察 CLL、MBL 和 SLL 样本中的突变数据,或进行比较性分析。由于当前归类为“肿瘤 / 其他”,它也可能适合归入肿瘤基因组数据资源中检索。不过,源站未提供具体推荐应用、分析目标、临床用途或验证结论,因此不宜在此描述其临床决策价值或特定研究结论。使用者若将其用于科研分析,应理解其可见内容主要是突变数据,并需自行判断其是否适合所关注的问题。

【使用方法】

该数据集发布在 cbioportal.org,可通过该来源站进行访问和检索。关于下载格式、文件结构、数据量、访问权限、是否需要注册、是否提供 API、是否支持在线分析、可视化方式及配套工具,源站未提供。由于源站标题和描述只给出数据主题与突变数据范围,未说明具体操作路径,因此无法进一步描述如何筛选 CLL、MBL 或 SLL 子集,也无法说明如何导出突变列表或进行统计比较。

【质量与限制】

源站未提供该数据集的质量评估、数据完整性、测序深度、覆盖范围、批次效应、样本排除标准、混杂因素控制或使用限制。可以明确的是,源站描述显示其内容为突变数据,样本涉及 428 例 CLL、54 例 MBL 和 24 例 SLL 的肿瘤/正常配对;除此之外,其他组学层面和临床层面的信息源站未提供。因此,使用时应以 cBioPortal 源站页面和关联文献中的说明为准,但源站未提供具体的引用与使用条款。对于数据是否经过统一质控、是否适合跨疾病比较、是否存在潜在重复样本等问题,现有信息不足以判断。

【引用与许可】

引用该数据集时,可使用其英文名称 cBioPortal: Chronic Lymphocytic Leukemia (IUOPA, Nature 2015)、源站标题 Chronic Lymphocytic Leukemia (IUOPA, Nature 2015),以及关联标识 pmid:26200345。主题标记为 cllsll。关于正式引用格式、作者列表、期刊信息、许可协议、数据使用条款、再分发限制和商业使用规定,源站未提供。使用者如需正式引用或判断许可条件,应参考 cBioPortal 源站页面及对应文献中的说明,但源站未提供这些细节。

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://cbioportal.org/study/summary?id=cll_iuopa_2015

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

来自428例CLL、54例MBL和24例SLL肿瘤/正常配对样本的全基因组或全外显子组测序的突变数据。

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