cBioPortal:慢性淋巴细胞白血病(ICGC,Nature Genetics 2011)

主题标签为 cllsll,本站分类归入“肿瘤 / 其他”。源站描述指出,它包含 105 例慢性淋巴细胞白血病样本的全外显子测序

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基因组cllsll
cBioPortal: Chronic lymphocytic leukemia (ICGC, Nature Genetics 2011)

基本信息

模态
基因组
创建/更新时间
2026-10-01

资源简介

cBioPortal:慢性淋巴细胞白血病(ICGC,Nature Genetics 2011)

该数据集是 cbioportal.org 上一个以“Chronic lymphocytic leukemia (ICGC, Nature Genetics 2011)”为标题的资源,中文可理解为与慢性淋巴细胞白血病相关的 ICGC、Nature Genetics 2011 数据条目。主题标签为 cllsll,本站分类归入“肿瘤 / 其他”。源站描述指出,它包含 105 例慢性淋巴细胞白血病样本的全外显子测序。该条目列出的关联编号为 pmid:22158541。总体而言,这是一个围绕慢性淋巴细胞白血病全外显子测序建立的门户条目。

【数据集背景】

源站标题为“Chronic lymphocytic leukemia (ICGC, Nature Genetics 2011)”,标题中出现的 ICGC 与 Nature Genetics 2011 是该条目的识别信息。慢性淋巴细胞白血病属于血液系统肿瘤,常被纳入肿瘤基因组学研究。全外显子测序则是基因组研究中常见的技术策略,用于考察样本中蛋白质编码区域及相关序列的变化。关于该数据集的建立背景、研究目的、组织来源、项目协作细节、样本招募方式等,源站未提供。

【数据内容】

源站描述写明为“Whole-exome sequencing of 105 Chronic lymphocytic Leukemia samples.”,因此数据内容的核心是 105 例慢性淋巴细胞白血病样本的全外显子测序。主题标签为 cllsll,本站分类为肿瘤 / 其他。关于数据中具体包含哪些基因、变异类型、临床注释、表达信息、拷贝数信息、生存信息、文件类型、样本元数据、患者特征等,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站是 cbioportal.org,源站标题与 ICGC、Nature Genetics 2011 相关,关联编号为 pmid:22158541。关于样本采集地点、采集时间、所属机构、测序平台、建库方法、质控流程、伦理审批、知情同意、样本处理与保存条件等,源站未提供。

【适用场景】

从数据类型和来源看,该数据集可用于对慢性淋巴细胞白血病、全外显子测序、肿瘤基因组学感兴趣的研究人员,作为在 cbioportal.org 上查找相关数据的入口。主题标签 cllsll 可作为检索线索。关于该数据集是否适合临床诊断、预后判断、治疗选择、药物开发、生物标志物验证等具体应用,源站未提供,使用时需以源站说明为准。

【使用方法】

作为 cbioportal.org 上的资源,访问和使用应遵循该来源站自身的导航、检索和数据获取流程。关于该条目的具体下载方式、文件格式、API 接口、可视化工具、账号权限、分析教程等,源站未提供。用户若需使用,应前往 cbioportal.org 查看该标题对应的页面,并根据页面提供的信息进行操作。

【质量与限制】

已知源站描述提到 105 例样本的全外显子测序。关于数据质量、测序深度、覆盖均一性、样本重复、污染控制、变异验证、临床随访完整性、人群代表性、版本更新、已知限制等,源站未提供。上述信息的缺失可能影响对数据适用性的判断,但具体影响需结合源站页面进一步确认。

【引用与许可】

引用时可以使用源站标题“Chronic lymphocytic leukemia (ICGC, Nature Genetics 2011)”,并参考关联编号 pmid:22158541。关于许可协议、使用条款、再分发条件、商业使用限制、伦理审查要求、引用格式细节等,源站未提供。用户应遵循 cbioportal.org 以及相应数据提供方提出的要求。

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://cbioportal.org/study/summary?id=cllsll_icgc_2011

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

对105份慢性淋巴细胞白血病样本进行全外显子组测序。

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