cBioPortal:慢性淋巴细胞白血病(Broad,Nature 2015)
该数据集是 cBioPortal 收录的慢性淋巴细胞白血病研究数据,标题为 Chronic Lymphocytic Leukemia (Broad, Nature 2015),核心内容为 537 对肿瘤/正常样本的全外显子测序,相关文献标识为 pmid:26466571

基本信息
资源简介
cBioPortal:慢性淋巴细胞白血病(Broad,Nature 2015)
该数据集是 cBioPortal 收录的慢性淋巴细胞白血病研究数据,标题为 Chronic Lymphocytic Leukemia (Broad, Nature 2015),核心内容为 537 对肿瘤/正常样本的全外显子测序,相关文献标识为 pmid:26466571。
【数据集背景】
慢性淋巴细胞白血病是一种血液系统恶性肿瘤,属于肿瘤基因组学研究关注的对象。该数据集在来源站上的标题为 Chronic Lymphocytic Leukemia (Broad, Nature 2015),标题中带有 Broad 与 Nature 2015 字样。其来源站为 cbioportal.org,在该站的分类中归入肿瘤 / 其他,主题标签为 cllsll。源站描述指出,该数据来自 537 对慢性淋巴细胞白血病肿瘤/正常样本的全外显子测序。除这些信息外,关于研究团队、具体机构、队列来源、发表期刊卷期、研究设计细节等背景,源站未提供。
【数据内容】
数据内容以全外显子测序为核心,覆盖 537 对慢性淋巴细胞白血病肿瘤/正常配对样本。全外显子测序通常针对基因组中的蛋白编码区域进行捕获和测序,可用于分析肿瘤与正常样本之间的差异。该数据集明确包含肿瘤与正常样本的配对关系,因此其基本结构适合围绕肿瘤/正常配对开展比较分析。至于具体包含哪些基因、突变列表、拷贝数变化、结构变异、表达信息、甲基化信息、临床注释、随访数据、样本人口学特征、测序平台、覆盖深度、变异检出流程等,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 cbioportal.org。源站给出的标题为 Chronic Lymphocytic Leukemia (Broad, Nature 2015),源站描述为 537 对慢性淋巴细胞白血病肿瘤/正常样本的全外显子测序,文献标识为 pmid:26466571。关于样本采集地区、采集时间、医疗机构、伦理审批、样本处理方式、测序服务提供方、数据提交与整合流程等,源站未提供。
【适用场景】
该数据集可用于慢性淋巴细胞白血病的肿瘤基因组研究,也可用于围绕肿瘤/正常配对样本开展全外显子测序数据分析。由于数据托管于 cBioPortal,用户可能将其用于平台内的浏览、检索和结合其他研究进行探索。是否适合临床诊断、预后判断、疗效预测、药物靶点筛选等具体应用,取决于数据中是否包含相应注释和验证信息;这些信息源站未提供。因此,上述场景只应作为一般性研究方向理解,不能视为该数据集已经具备相应临床用途。
【使用方法】
用户可前往 cbioportal.org,以标题 Chronic Lymphocytic Leukemia (Broad, Nature 2015) 查找该数据集。关于具体下载格式、文件清单、API 接口、数据版本、更新频率、是否需要注册或申请权限等,源站未提供。若需要引用,可使用源站给出的文献标识 pmid:26466571 作为检索线索。具体操作流程和平台使用规则,应以 cbioportal.org 对应页面为准。
【质量与限制】
该数据集包含 537 对肿瘤/正常样本,样本规模在全外显子测序研究中具有一定体量。全外显子测序通常聚焦蛋白编码区域,对非编码区、深度内含子区以及部分结构变异和大片段变异的覆盖能力有限,这是该方法学的一般特点。该数据集具体的覆盖度、质控指标、变异检出灵敏度、批次效应、重复样本情况、正常对照质量等,源站未提供。此外,该数据是否能够代表更广泛的慢性淋巴细胞白血病人群,以及是否存在选择偏倚,源站未提供。使用者应结合原始研究文献和源站页面进一步核实。
【引用与许可】
源站给出的文献标识为 pmid:26466571,可作为查找对应文献和引用线索。该数据集的许可协议、使用限制、商业使用规定、再分发条件、作者列表、正式引用格式等,源站未提供。使用者应回到 cbioportal.org 对应数据集页面,核实最新许可与引用要求。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://cbioportal.org/study/summary?id=cll_broad_2015
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
537对慢性淋巴细胞白血病肿瘤/正常配对样本的全外显子组测序。
数据缺失?
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