结肠壁生物因子数据集：胶原蛋白与弹性蛋白水平及患者年龄、性别、结肠段和BMI
引言：结肠是胃肠道的重要组成部分，其复杂结构由细胞外基质（ECM）支撑，ECM主要由胶原蛋白和弹性蛋白构成。理解结肠壁中各种胶原蛋白类型和弹性蛋白等ECM成分的分布及其与人口学因素的相关性，对于认识结肠生理及其对胃肠道健康的影响至关重要
基本信息
资源简介
结肠壁生物因子数据集：胶原蛋白与弹性蛋白水平及患者年龄、性别、结肠段和BMI
结肠是胃肠道的重要组成部分，其复杂结构由细胞外基质（ECM）支撑，而ECM主要由胶原蛋白和弹性蛋白构成。理解结肠壁中各种胶原蛋白类型和弹性蛋白等ECM成分的分布及其与人口学因素的相关性，对于认识结肠生理及其对胃肠道健康的影响至关重要。本数据集题为“An Insight to Biological Factors of the Colon Wall: Data Set of Collagen and Elastin Levels Alongside Patient Age, Gender, Colon Segment, and BMI”，由Mirzaee Kakhki, Elyas、Wartmann, Thomas、Boese, Axel、Kahlert, Ulf Dietrich与Cora, Wex共同完成，发布于Zenodo平台，发布时间为2024年，采用Creative Commons Attribution 4.0 International许可。数据集聚焦结肠壁生物因素，涵盖胶原蛋白与弹性蛋白水平，并关联患者年龄、性别、结肠节段与BMI等信息，为相关研究提供真实世界数据基础。
【数据集背景】
结肠作为胃肠道的关键部分，其结构支撑依赖于细胞外基质，而胶原蛋白和弹性蛋白是ECM的主要成分。了解各种胶原蛋白类型和弹性蛋白在结肠壁中的分布，以及它们与人口学因素之间的相关性，是理解结肠生理及其对胃肠道健康影响的重要前提。这些认识有助于阐明与年龄相关的胃肠道疾病、性别特异性疾病，并可能为胃肠道重建的组织工程应用提供潜在价值。该数据集的独特之处在于，其样本直接采集自患者的手术过程，因而提供了真实世界的数据，而非仅来自模拟或间接推断。数据集的主题标签包括colon wall、extracellular matrix、demographic factors、collagen types、elastin distribution、aging以及adipositas，反映出其关注结肠壁ECM成分与人口学及体重相关因素之间的关联。
【数据内容】
数据集包含患者年龄、性别、结肠节段以及BMI等信息，并与胶原蛋白和弹性蛋白水平相关联。具体而言，数据涉及结肠壁中不同胶原蛋白类型和弹性蛋白的分布情况，同时记录对应患者的年龄、性别、结肠节段和BMI。源站描述在“Data Set Overview”部分提及了患者年龄、性别、结肠节段等信息，但该段落在提供的描述中未完整结束，因此关于数据集中变量数量、样本量、具体胶原蛋白类型清单、弹性蛋白测量单位或数值范围等细节，源站未提供。数据集的主题标签提示其涉及衰老（aging）与肥胖（adipositas）相关因素，但具体如何在这些维度上组织数据，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集的样本直接采集自患者的手术过程，这是其区别于许多其他数据集的核心特点，能够提供真实世界的数据。数据集的作者包括Mirzaee Kakhki, Elyas、Wartmann, Thomas、Boese, Axel、Kahlert, Ulf Dietrich以及Cora, Wex，机构为Zenodo，发布时间为2024年，来源站为doi.org。关于样本采集的具体手术类型、采集地点、伦理审批信息、样本处理与保存方法、测量胶原蛋白与弹性蛋白所采用的技术手段等，源站未提供。
【适用场景】
基于数据集的内容与背景，其潜在适用场景包括：研究结肠壁细胞外基质中胶原蛋白与弹性蛋白的分布及其与年龄、性别、结肠节段和BMI等人口学因素的相关性；探讨与年龄相关的胃肠道疾病和性别特异性疾病；以及为胃肠道重建的组织工程应用提供参考数据。此外，主题标签中的aging和adipositas提示该数据集可能用于涉及衰老与肥胖因素的分析。然而，源站未提供关于具体应用案例、已验证的分析用途或推荐分析流程的说明。
【使用方法】
源站未提供关于数据下载方式、文件格式、数据结构、变量命名规则、缺失值处理建议或分析工具要求的具体说明。使用者需依据Zenodo平台上的数据集页面获取进一步信息。由于源站描述未完整覆盖数据集的全部细节，建议在使用前查阅数据集在doi.org上的完整记录，以确认数据组织方式与适用条件。
【质量与限制】
该数据集的一个显著优势在于样本直接来自患者手术过程，提供真实世界数据，这有助于增强研究结果的现实相关性。然而，源站未提供关于样本量、数据完整性、测量误差、批次效应、人口学代表性或潜在偏倚的详细信息。此外，源站描述在“Data Set Overview”部分未完整结束，因此关于数据覆盖范围与变量细节的完整说明尚不明确。使用者应留意这些未提供的信息，并在分析时谨慎解释结果。
【引用与许可】
该数据集采用Creative Commons Attribution 4.0 International许可，允许在署名条件下共享与改编。引用时需注明数据集英文名、作者（Mirzaee Kakhki, Elyas、Wartmann, Thomas、Boese, Axel、Kahlert, Ulf Dietrich、Cora, Wex）、机构（Zenodo）、发布时间（2024）以及来源站（doi.org）。关于具体的引用格式、DOI标识符或推荐引用文本，源站未提供。
下载信息
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暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
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数据集获取
源站：https://doi.org/10.5281/zenodo.14576125
标准获取流程：
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- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 11.4 KB。
数据说明
引言：结肠是胃肠道的重要组成部分，其复杂结构由细胞外基质（ECM）支撑，主要由胶原蛋白和弹性蛋白构成。了解结肠壁中各种胶原类型和弹性蛋白等ECM成分的分布及其与人口学因素的相关性，对于理解结肠生理学及其对胃肠道健康的影响至关重要。这些见解有助于阐明与年龄相关的胃肠道疾病、性别特异性疾病，以及在胃肠道重建组织工程中的潜在应用。本数据集独特之处在于其使用了手术过程中直接从患者采集的样本，提供了真实世界数据。数据集概述：本数据集包含患者的年龄、性别、结肠段和BMI信息，以及使用ELISA获得的I型、III型、IV型、X型胶原蛋白和弹性蛋白的测量值。这些数据呈现在数据集的第1至第10列中。需要注意的是，胶原蛋白和弹性蛋白的数值为重复测量的平均值，以确保可靠性。
此处建立了具体的纳入标准。患有常见结肠疾病如炎症性肠病（IBD）、憩室炎或肠易激综合征（IBS）的患者被排除在外。该数据集包含来自一个由41名诊断为结肠癌的患者组成的研究组的数据。手术期间收集的初始样本量主要取决于外科医生对结肠肿瘤特征及安全切除所需边缘的评估。外科医生决定切除的健康边缘量。该数据集用于研究结肠壁中各种胶原类型和弹性蛋白的丰度及其相互关系，以及它们与人口统计学因素的关联。以下，为进一步阐明收集样本的过程
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
