腺样囊性癌基因-疾病关联数据集

资源简介

腺样囊性癌基因-疾病关联数据集

DataSheet2_Transcriptomic insights into adenoid cystic carcinoma via RNA sequencing.DOCX

该数据集来自 frontiersin.figshare.com，为腺样囊性癌（ACC）转录组研究的配套数据表，包含 1 个 DOCX 文件。源站描述显示，研究对 15 例 ACC 患者的配对肿瘤与正常唾液腺组织进行 RNA sequencing，分析差异表达、基因富集、免疫细胞浸润及基因融合（MYB-NFIB、MYBL1-NFIB 及新发现的 TVP23C-CDRT4），并涉及 PRAME 上调与 HLA 基因下调。数据可用于 ACC 转录组层面的基因-疾病关联分析、基因融合与免疫微环境研究（来源 figshare，CC BY 4.0 许可）。

【数据集背景】

配套论文《The utility of TP53 and PIK3CA mutations as prognostic biomarkers in salivary adenoid cystic carcinoma》发表于 Oral Oncology（2021），DOI：10.1016/j.oraloncology.2020.105095。源站首次发布：2023-04-21。

【数据内容】

源站描述（机器翻译，仅供参考）：背景：本研究旨在转录组水平探讨腺样囊性癌（ACC）的潜在机制。材料与方法：我们获取了 15 例 ACC 患者的配对肿瘤与正常唾液腺组织，用于 RNA sequencing。结果：基因富集分析显示，上调通路主要涉及轴突生成，下调通路主要与白细胞迁移、适应性免疫应答、淋巴细胞介导的免疫及体液免疫应答相关。T 细胞、B 细胞和 NK 细胞在 ACC 组织中浸润较低。除基因融合 MYB-NFIB 和 MYBL1-NFIB 外，还在 3 例 ACC 组织中检测到新的基因融合 TVP23C-CDRT4。PRAME 在 ACC 组织中显著上调，而抗原呈递的人类白细胞抗原（HLA）基因下调。结论

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个，合计 24.04 KB。数据集 DOI：10.3389/fgene.2023.1144945.s002。

【主题与分类】

源站学科分类：Gene and Molecular Therapy、Gene Expression (incl. Microarray and other genome-wide approaches)、Genetics、Genetically Modified Animals、Livestock Cloning、Developmental Genetics (incl. Sex Determination)。主题标签：adenoid cystic carcinoma (ACC)、RNA sequencing、gene fusions、cancer germline antigens、mRNA。本站分类：肿瘤。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Gene and Molecular Therapy、Gene Expression (incl. Microarray and other genome-wide approaches)、Genetics、Genetically Modified Animals、Livestock Cloning、Developmental Genetics (incl. Sex Determination)。

【获取与许可】

源站页面：https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/DataSheet2_Transcriptomic_insights_into_adenoid_cystic_carcinoma_via_RNA_sequencing_DOCX/22671814

使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。

规范引用：Tang, Yu-Fang; An, Pu-Gen; Gu, Bao-Xin; Yi, Shu; Hu, Xiao; Wu, Wen-Jie; et al. (2023). DataSheet2_Transcriptomic insights into adenoid cystic carcinoma via RNA sequencing.DOCX. Frontiers. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-06-21，引用时请注意版本时效。