低级别与高级别结肠腺癌组织及组织来源原代细胞系的蛋白质组分析补充文件6

该数据为蛋白质组分析研究的补充文件6,包含结肠腺癌组织来源原代细胞系中鉴定到的全部蛋白质列表,以及高级别结肠腺癌细胞系相对于低级别结肠腺癌细胞系丰度显著差异的蛋白质列表

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2023-06-16 更新
浏览 2
蛋白质分类BiomarkerColon adenocarcinomaColorectal cancerLabel-free quantitationProteomics
Additional file 6 of Proteomic analysis of low- and high-grade human colon adenocarcinoma tissues and tissue-derived primary cell lines reveals unique biological functions of tumours and new protein biomarker candidates

基本信息

模态
蛋白质
大小
0.000775877 GB
任务类型
分类
许可
CC BY + CC0
创建/更新时间
2023-06-16
版本
v1

资源简介

低级别与高级别结肠腺癌组织及组织来源原代细胞系的蛋白质组分析补充文件6

Additional file 6 of Proteomic analysis of low- and high-grade human colon adenocarcinoma tissues and tissue-derived primary cell lines reveals unique biological functions of tumours and new protein biomarker candidates

该数据为蛋白质组分析研究的补充文件6,包含结肠腺癌组织来源原代细胞系中鉴定到的全部蛋白质列表,以及高级别结肠腺癌细胞系相对于低级别结肠腺癌细胞系丰度显著差异的蛋白质列表。数据以Excel文件形式提供,图例见Sheet 1,涉及LG、HG、NC等缩写。该数据可用于筛选结肠腺癌相关蛋白质生物标志物候选,支持肿瘤分级相关生物学功能研究(来源 figshare,CC BY + CC0 许可)。

【数据集背景】

配套论文《Identification of serum biomarkers for colon cancer by proteomic analysis》发表于 British Journal of Cancer(2006),DOI:10.1038/sj.bjc.6603188。源站首次发布:2022-07-18。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):补充文件6。列出了在CA组织来源原代细胞系中鉴定到的所有蛋白质,以及HGCA细胞系相对于LGCA细胞系丰度显著差异的蛋白质。图例见Sheet 1。缩写:LG = 低级别结肠腺癌,HG = 高级别结肠腺癌,NC = 正常结肠。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 775.88 KB。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.20330047.v1。

【主题与分类】

源站学科分类:Biophysics、Biochemistry、Cell Biology、Genetics、Molecular Biology、Biotechnology。主题标签:Biomarker、Colon adenocarcinoma、Colorectal cancer、Label-free quantitation、Proteomics。本站分类:肿瘤。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Biophysics、Biochemistry、Cell Biology、Genetics、Molecular Biology、Biotechnology。

【获取与许可】

源站页面:https://springernature.figshare.com/articles/dataset/Additional_file_6_of_Proteomic_analysis_of_low-_and_high-grade_human_colon_adenocarcinoma_tissues_and_tissue-derived_primary_cell_lines_reveals_unique_biological_functions_of_tumours_and_new_protein_biomarker_candidates/20330047

使用许可:CC BY + CC0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Munro, Matthew J.; Wickremesekera, Susrutha K.; Tan, Swee T.; Peng, Lifeng (2022). Additional file 6 of Proteomic analysis of low- and high-grade human colon adenocarcinoma tissues and tissue-derived primary cell lines reveals unique biological functions of tumours and new protein biomarker candidat…

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-06-16,引用时请注意版本时效。

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数据集获取(Figshare)

命令行下载

curl -L -o "12014_2022_9364_MOESM6_ESM.xlsx" "https://ndownloader.figshare.com/files/36331798"

文件清单

  • 12014_2022_9364_MOESM6_ESM.xlsx(775.88 KB)

文件总体积 775.88 KB(源站 API 实测)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

补充文件6。CA组织来源原代细胞系中鉴定的所有蛋白质列表,以及HGCA细胞系相对于LGCA细胞系丰度存在显著差异的蛋白质列表。图例见工作表1。缩写:LG = 低级别结肠腺癌,HG = 高级别结肠腺癌,NC = 正常结肠。

许可

CC BY + CC0

引用

学术使用请引用 DOI 10.6084/m9.figshare.20330047.v1(source: https://springernature.figshare.com/articles/dataset/Additional_file_6_of_Proteomic_analysis_of_low-_and_high-grade_human_colon_adenocarcinoma_tissues_and_tissue-derived_primary_cell_lines_reveals_unique_biological_functions_of_tumours_and_new_protein_biomarker_candidates/20330047)。

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