全长异构体串联测序解析癌症转录组复杂性的补充文件4
内容为在HBR_SIRV短读长RNA-Seq的三个重复中鉴定出的TPM值等于0.5的低表达转录本。数据可用于肿瘤转录组分析、低表达转录本识别及长读长RNA测序相关的异构体发现研究（来源 figshare，CC BY + CC0 许可）
基本信息
资源简介
全长异构体串联测序解析癌症转录组复杂性的补充文件4
Additional file 4 of Full-length isoform concatenation sequencing to resolve cancer transcriptome complexity
该数据集为论文《Full-length isoform concatenation sequencing to resolve cancer transcriptome complexity》的补充文件4，来源于Springer Nature Figshare，包含1个Excel文件。内容为在HBR_SIRV短读长RNA-Seq的三个重复中鉴定出的TPM值等于0.5的低表达转录本。数据可用于肿瘤转录组分析、低表达转录本识别及长读长RNA测序相关的异构体发现研究（来源 figshare，CC BY + CC0 许可）。
【数据集背景】
配套论文《Integrative Clinical Sequencing in the Management of Refractory or Relapsed Cancer in Youth》发表于 JAMA（2015），DOI：10.1001/jama.2015.10080。源站首次发布：2024-08-14。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：补充文件4。低表达转录本，定义为在HBR_SIRV短读长RNA-Seq的三个重复中鉴定出的TPM值等于0.5的转录本。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 17.60 KB。数据集 DOI：10.6084/m9.figshare.26673894.v1。
【主题与分类】
源站学科分类：Genetics。主题标签：Long-read RNA sequencing、Concatenation、Isoform discovery、Tumor transcriptome。本站分类：肿瘤。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Genetics。
【获取与许可】
源站页面：https://springernature.figshare.com/articles/dataset/Additional_file_4_of_Full-length_isoform_concatenation_sequencing_to_resolve_cancer_transcriptome_complexity/26673894
使用许可：CC BY + CC0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Wijeratne, Saranga; Gonzalez, Maria E. Hernandez; Roach, Kelli; Miller, Katherine E.; Schieffer, Kathleen M.; Fitch, James R.; et al. (2024). Additional file 4 of Full-length isoform concatenation sequencing to resolve cancer transcriptome complexity. figshare. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2024-08-18，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取（Figshare）
- 源站标题：Additional file 4 of Full-length isoform concatenation sequencing to resolve cancer transcriptome complexity
- DOI：10.6084/m9.figshare.26673894.v1
- 发布日期：2024-08-14
- 文件数：1 个
- 文件总体积：17.60 KB
- 源站页面：https://springernature.figshare.com/articles/dataset/Additional_file_4_of_Full-length_isoform_concatenation_sequencing_to_resolve_cancer_transcriptome_complexity/26673894
命令行下载
curl -L -o "12864_2024_10021_MOESM4_ESM.xlsx" "https://ndownloader.figshare.com/files/48514710"
文件清单
12864_2024_10021_MOESM4_ESM.xlsx（17.60 KB）
文件总体积 17.60 KB（源站 API 实测）。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据说明
Additional file 4. Lowly-expressed transcripts characterized as those transcripts with a TPM value equal to 0.5 identified in three replicates of HBR_SIRV short-read RNA-Seq.
许可
CC BY + CC0
引用
学术使用请引用 DOI 10.6084/m9.figshare.26673894.v1（source: https://springernature.figshare.com/articles/dataset/Additional_file_4_of_Full-length_isoform_concatenation_sequencing_to_resolve_cancer_transcriptome_complexity/26673894）。
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