全长异构体串联测序解析癌症转录组复杂性的补充文件10

数据可用于肿瘤转录组中异构体发现与基因表达分析,支撑长读长RNA测序与串联测序方法在癌症转录组复杂性解析中的应用(来源 figshare,CC BY + CC0 许可)

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2024-08-18 更新
浏览 3
基因组Long-read RNA sequencingConcatenationIsoform discoveryTumor transcriptome
Additional file 10 of Full-length isoform concatenation sequencing to resolve cancer transcriptome complexity

基本信息

模态
基因组
大小
0.000039706 GB
许可
CC BY + CC0
创建/更新时间
2024-08-18
版本
v1

资源简介

全长异构体串联测序解析癌症转录组复杂性的补充文件10

Additional file 10 of Full-length isoform concatenation sequencing to resolve cancer transcriptome complexity

该数据集为论文《Full-length isoform concatenation sequencing to resolve cancer transcriptome complexity》的补充文件10,来源于springernature.figshare.com,包含1个Excel文件,列出肿瘤富集基因及其长读长计数和短读长TPM值(≥10)。数据可用于肿瘤转录组中异构体发现与基因表达分析,支撑长读长RNA测序与串联测序方法在癌症转录组复杂性解析中的应用(来源 figshare,CC BY + CC0 许可)。

【数据集背景】

配套论文《Integrative Clinical Sequencing in the Management of Refractory or Relapsed Cancer in Youth》发表于 JAMA(2015),DOI:10.1001/jama.2015.10080。源站首次发布:2024-08-14。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):补充文件10. 肿瘤富集基因,其长读长计数及短读长TPM值均≥10。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 39.71 KB。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.26673912.v1。

【主题与分类】

源站学科分类:Genetics。主题标签:Long-read RNA sequencing、Concatenation、Isoform discovery、Tumor transcriptome。本站分类:肿瘤。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Genetics。

【获取与许可】

源站页面:https://springernature.figshare.com/articles/dataset/Additional_file_10_of_Full-length_isoform_concatenation_sequencing_to_resolve_cancer_transcriptome_complexity/26673912

使用许可:CC BY + CC0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Wijeratne, Saranga; Gonzalez, Maria E. Hernandez; Roach, Kelli; Miller, Katherine E.; Schieffer, Kathleen M.; Fitch, James R.; et al. (2024). Additional file 10 of Full-length isoform concatenation sequencing to resolve cancer transcriptome complexity. figshare. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2024-08-18,引用时请注意版本时效。

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数据集获取(Figshare)

命令行下载

curl -L -o "12864_2024_10021_MOESM10_ESM.xlsx" "https://ndownloader.figshare.com/files/48514728"

文件清单

  • 12864_2024_10021_MOESM10_ESM.xlsx(39.71 KB)

文件总体积 39.71 KB(源站 API 实测)。

数据说明

Additional file 10. Tumor enriched genes with long-read count and short-read TPM value 10 or greater.

许可

CC BY + CC0

引用

学术使用请引用 DOI 10.6084/m9.figshare.26673912.v1(source: https://springernature.figshare.com/articles/dataset/Additional_file_10_of_Full-length_isoform_concatenation_sequencing_to_resolve_cancer_transcriptome_complexity/26673912)。

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