CENPN敲低后鼻咽癌5-8F细胞的转录组分析

该数据集包含经过log2转换的基因表达矩阵(文本格式),源自CENPN敲低处理的鼻咽癌5-8F细胞的RNA测序数据,主要用于研究CENPN基因在鼻咽癌发生发展中的功能,可应用于癌症分子机制探索、基因表达调控分析以及潜在生物标志物或治疗靶点的识别。

Figshare
2025-05-13 更新
浏览 33
分类transcriptomeexpression matrixRNA-seqCENPNnasopharyngeal carcinom
Transcriptome profiling of nasopharyngeal carcinoma 5-8F cells after CENPN knockdown

基本信息

大小
0.000855288 GB
任务类型
分类
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2025-05-13
版本
v1

资源简介

CENPN敲低后鼻咽癌5-8F细胞的转录组分析

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Transcriptome profiling of nasopharyngeal carcinoma 5-8F cells after CENPN knockdown》。项目资助方:National Natural Science Foundation of China [81770981]。源站首次发布:2025-05-13。

【数据内容】

源站原始描述:This dataset contains the processed RNA-seq expression matrix of nasopharyngeal carcinoma (NPC) 5-8F cells with stable knockdown of CENPN. RNA sequencing was performed using the Illumina HiSeq platform. Expression values were transformed using the formula log₂(value + 1) to facilitate downstream analysis and visualization. The dataset includes: - log2_expression_matrix.xls:a log₂-transformed gene expression matrix with genes as rows and samples as columns. - sample_info.xlsx: metadata including…

主表 log2_expression_matrix.xls 含 7 列、样本前 2000 行结构完整。

文件 README.txt 为文本内容,开头为:README – RNA-seq Expression Matrix for CENPN Knockdown in 5-8F Cells ==================================================================== 1. Project Title …

【数据结构与技术规格】

文件数 3 个,合计 855.29 KB。log2_expression_matrix.xls:text/plain,834.01 KB。sample_info.xlsx:application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet,19.46 KB。README.txt:text/plain,1.82 KB。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.29052638.v1。

【主题与分类】

源站学科分类:Gene expression (incl. microarray and other genome-wide approaches)。主题标签:transcriptome、expression matrix、RNA-seq、CENPN、nasopharyngeal carcinom。

【适用方向】

结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。源站学科分类标注为 Gene expression (incl. microarray and other genome-wide approaches)。

【获取与许可】

源站页面:https://figshare.com/articles/dataset/_b_Transcriptome_profiling_of_nasopharyngeal_carcinoma_5-8F_cells_after_CENPN_knockdown_b_/29052638

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Wang, Yufei; Qi, Chenglin; Huang, Maoling; Zou, You; Chen, Shiming (2025). Transcriptome profiling of nasopharyngeal carcinoma 5-8F cells after CENPN knockdown. figshare. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2025-05-14,引用时请注意版本时效。

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使用方式

数据集获取(Figshare)

源站:https://figshare.com/articles/dataset/_b_Transcriptome_profiling_of_nasopharyngeal_carcinoma_5-8F_cells_after_CENPN_knockdown_b_/29052638

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数据说明

该数据集包含稳定敲低CENPN基因的鼻咽癌5-8F细胞经过处理的RNA-seq表达矩阵。数据通过Illumina HiSeq平台进行RNA测序获得,表达值经过log2(value+1)转换,以方便下游分析和可视化。数据集包含三个文件:log2_expression_matrix.xls(以基因为行、样本为列的log2转换基因表达矩阵)、sample_info.xlsx(包含样本名称、处理条件和分组信息的元数据)以及README.txt(实验设计和数据处理步骤的说明)。该数据集主要用于研究CENPN基因在鼻咽癌中的功能,可应用于癌症分子机制、基因调控网络及潜在治疗靶点的探索。

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