南印度女性口腔肿瘤全外显子组测序数据集
南印度女性口腔鳞状细胞癌患者全外显子测序数据，识别了CASP8、TP53等关键突变基因及免疫相关性。
基本信息
模态
基因组
创建/更新时间
2026-10-08
资源简介
该数据集包含来自南印度队列的女性口腔鳞状细胞癌（OSCC）患者肿瘤组织的全外显子测序数据。共纳入38例患者，通过分析识别了10个显著突变基因（包括TP53、CDKN2A、HLA-B、CASP8）以及EGFR扩增和CDKN2A缺失。研究发现CASP8为最频繁突变的驱动基因，TP53突变与肿瘤异质性和较短无病生存期相关。还发现了Notch和PI3K-Akt信号通路的体细胞突变富集，以及肿瘤免疫浸润与特定体细胞改变的相关性。
下载信息
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源站：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra/ERP159330
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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