麻风分枝杆菌全基因组数据集
麻风分枝杆菌全基因组数据处理脚本管道。
基本信息
资源简介
麻风分枝杆菌全基因组数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《tusharbioinfo/M.-leprae-pipeline》。源站首次发布：2024-07-17。
【数据内容】
源站原始描述：The bash script pipeline for the mycobacterium leprae whole genome dataset # M.-leprae-pipeline The bash script pipeline for the mycobacterium leprae whole genome dataset first download the same env in the conda and download the all tool in the conda env
【适用方向】
组学数据适用于生物标志物发现与分子分型相关建模研究。
【获取与许可】
源站页面：https://github.com/tusharbioinfo/M.-leprae-pipeline
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
git clone https://github.com/tusharbioinfo/M.-leprae-pipeline.git
curl -L -o repo.zip https://github.com/tusharbioinfo/M.-leprae-pipeline/archive/refs/heads/main.zip
unzip repo.zip
源站 README 摘录（使用方式）
M.-leprae-pipeline
The bash script pipeline for the mycobacterium leprae whole genome dataset
first download the same env in the conda
and download the all tool in the conda env
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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