POG患者25921样本

来自上皮样间皮瘤患者的基因组和转录组序列数据,来源于BC癌症机构POG研究。

NIAID Data Ecosystem
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基因组上皮样间皮瘤基因组
POG_patient_25921 - samples

基本信息

模态
基因组
创建/更新时间
2026-10-10

资源简介

POG患者25921样本

【数据内容】

源站原始描述:The Long-read POG dataset comprises a cohort of 189 patient tumours and 41 matched normal samples sequenced using the Oxford Nanopore Technologies PromethION platform. This dataset from the Personalized Oncogenomics (POG) program and the Marathon of Hope Cancer Centres Network includes accompanying DNA and RNA short-read sequence data, analytics, and clinical information. We show the potential of long-read sequencing for resolving complex cancer-related structural variants, viral integrations, a…

中文译文(机器翻译,仅供快速理解,请以原文为准):长读长POG数据集包含一个由189例患者肿瘤和41份匹配正常样本组成的队列,这些样本使用Oxford Nanopore Technologies PromethION平台进行了测序。该数据集来自Personalized Oncogenomics(POG)

【适用方向】

组学数据适用于生物标志物发现与分子分型相关建模研究。

【获取与许可】

源站页面:https://www.omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001002646

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

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