间皮瘤基因组学研究 - 全基因组测序肿瘤/正常配对

恶性间皮瘤肿瘤与正常配对样本的全基因组测序数据,用于识别基因组改变和探索新疗法。

NIAID Data Ecosystem
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基因组间皮瘤基因组
Mesothelioma Genomics Study - WGS tumour/normal pairs

基本信息

模态
基因组
创建/更新时间
2026-10-11

资源简介

间皮瘤基因组学研究 - 全基因组测序肿瘤/正常配对

【数据内容】

源站原始描述:Malignant mesothelioma (MM) is an incurable and aggressive tumour that occurs principally in the pleura as a consequence of inhaling asbestos fibres. There are >15,000 cases per annum worldwide, the incidence is increasing and Australia has one of the world''s highest incidence rates. Surgery, chemotherapy and radiotherapy (or their combinations) all feature in the clinical management but do not impact significantly on overall survival. This study uses whole genome sequencing (WGS) with the aim o…

中文译文(机器翻译,仅供快速理解,请以原文为准):恶性间皮瘤(MM)是一种无法治愈且侵袭性强的肿瘤,主要发生于胸膜,是吸入石棉纤维的结果。全球每年有超过15,000例病例,发病率正在上升,而澳大利亚是世界上发病率最高的国家之一。手术、化疗和放疗(或它们的联合治疗)均应用于临床管理,但并未对总生存期产生显著影响。本研究使用全基因组测序(WGS),旨在识别与间皮瘤相关的基因组改变,并有可能发现新的治疗策略。

【适用方向】

组学数据适用于生物标志物发现与分子分型相关建模研究。

【获取与许可】

源站页面:https://www.omicsdi.org/dataset/ega/EGAS00001002299

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数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

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