默克尔细胞癌细胞系RNA-seq表达谱
从癌细胞系百科全书（CCLE）中提取的默克尔细胞癌（MCC）代表性细胞系的多组学测序数据，包括RNA-seq、突变谱以及对多种小分子药物的敏感性矩阵。由Broad Institute提供，来自DepMap Portal，数据格式为表格，包含8条数据记录，适用于分类任务，许可证为CC BY 4.0。
基本信息
资源简介
默克尔细胞癌细胞系RNA-seq表达谱
【一句话概览】
DepMap（癌症依赖图谱）项目由Broad Institute开展，其门户网站旨在通过开放获取关键癌症依赖性数据、分析及可视化工具，帮助研究界发现与癌症脆弱性相关的成果。该项目涉及癌症、依赖图谱、CRISPR、基因组学、蛋白质组学、细胞系及儿科等方向（来源 depmap.org）。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《DepMap: The Cancer Dependency Map Project at Broad Institute》。
【数据内容】
源站原始描述：The goal of the Dependency Map (DepMap) portal is to empower the research community to make discoveries related to cancer vulnerabilities by providing open access to key cancer dependencies, analytical, and visualization tools
中文译文（机器翻译，仅供快速理解，请以原文为准）：依赖图谱（DepMap）门户的目标是通过提供对关键癌症依赖性、分析及可视化工具的开放访问，赋能研究界在癌症脆弱性方面做出发现。
【主题与分类】
主题标签：cancer、dependency map、CRISPR、genomics、proteomics、cell lines、pediatric、DepMap。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面：https://depmap.org/portal/
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
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使用方式
数据集获取
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 2.40 GB。
数据说明
从癌细胞系百科全书（CCLE）中提取的默克尔细胞癌（MCC）代表性细胞系的多组学测序数据，包括RNA-seq、突变谱以及对多种小分子药物的敏感性矩阵。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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